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Nom complet Nom abrégé Résumé
UC2-04-Bioéthique et Biovigilance_2024-25 APT_2092_UC2_04_2024_25 Les principes philosophiques. Les lois de bioéthique. L'éthique dans l'exploration spatiale - La recherche sur les gènes, cellules, organes/organoïdes - l'édition du génome - Les cellules souches - Le don d'organes - La médecine prédictive - La recherche biomédicale et l'éthique de la recherche sur l'homme - L'éthique des expérimentations animales - La brevetabilité du vivant - Les neurosciences - L'agence de biomédecine. Voir le cours
UC2-05-Biotechnologies animales_2024-25 APT_2093_UC2_05_2024_25 Biotechnologies du génome : génomique structurale et fonctionnelle, transcriptomique, protéomique - présentation, applications et limites de ces approches à haut débit.Biotechnologies de la reproduction : transplantation embryonnaire, fécondation in vitro, sexage, clonage, transgenèse animale.Biotechnologies des aliments et de la nutrition, conséquences pour la qualité des produits animaux et la sécurité du consommateur.Etat des lieux et marché actuel de ces biotechnologies.Bioéthique, brevetabilité du vivant, acceptation sociale. Voir le cours
UC2-09-Economie et gestion de la santé_2024-25 APT_2095_UC2_09_2024_25 Plusieurs difficultés ont émergé ces dernières décennies dans le domaine de la santé (déficit du secteur de la santé, gestion de la sécurité sanitaire). Ainsi, l'analyse de l'efficacité et l'efficience économique du système de santé ainsi que le management du secteur de santé et ses risques deviennent essentielles.Ce cours s'adresse aux étudiants intéressés par les métiers touchant au secteur de la santé : postes de cadre, contrôleur de gestion, manager ou chargé de mission dans les organisations du secteur de la santé (publiques ou privées, à finalité économique ou non), organisations sanitaires (hôpitaux, cliniques), organisations médico-sociales (établissements d'hébergement des personnes âgées dépendantes, institutions d’accueil des personnes handicapées...),  structures associatives œuvrant dans le domaine de la santé…, dans les établissements dont l’activité est liée au bien-être et à la santé (établissements thermaux, instituts de thalassothérapie, spas, entreprises de cosmétiques, entreprises de luxe…), dans les instances de tutelle ou de régulation de ces organisations (ARS, Conseils Généraux...). Voir le cours
UC2-15-Mécanismes et évolution de la pathogénie : interactions cellulaires_2024-25 APT_2097_UC2_15_2024_25 Introduction à la biologie et à l'écologie des pathogènes : bactéries, virus, champignons et autres parasites.  Défenses immunes de l'homme et des plantes vis-à-vis des agents infectieux.  Mécanismes de la pathogénie, détournement des fonctions cellulaires et en particulier du système immunitaire.  Ecologie des interactions microbe-animaux, microbes-plantes.  Techniques d'étude des mécanismes de pathogénie des microbes.  Génétique et évolution de la pathogénie, transferts de l'information génétique, évolution des structures.  Coût social des maladies infectieuses, moyens de lutte. Voir le cours
UC2-17-Méthodes et outils d'analyse spatiale et de diagnostic sylvicole_2024-25 APT_2098_UC2_17_2024_25 SIG : cours et TD permettant une utilisation de base des systèmes d'information géographique et des GPS (acquisition et navigation).Application de ces connaissances (et de celles déjà abordées dans d'autres UC du SCD1-forêt en sylviculture et dendrométrie) au cours d'un mini-projet de diagnostic de stations et peuplements forestiers à l'échelle d'un groupe de parcelles. Voir le cours
UC2-19-Microbiologie alimentaire_2024-25 APT_2099_UC2_19_2024_25 Cette UC s'intéresse à deux aspects de la microbiologe alimentaire: les microorganismes d'intérêt alimentaire appelés également technologiques et les microorganismes indésirables (flore pathogène et flore d'altération).L'UC a pour objectifs de :- Montrer comment les fermentations sont utilisées pour obtenir un aliment avec des qualités sensorielles, nutritionnelles et sanitaires recherchées. A travers l'exemples de certains aliments fermentés, les microorganismes impliqués, leur dynamique de croissance, leur métabolisme seront présentés.-Présenter les principaux dangers microbiologiques avérés, suspectés ou émergents. Les démarches d'appréciation quantitative du risque (AQR) et de détermination d'une DLC seront abordées par l'étude de cas concrets.L'UC aura pour fil conducteur un projet de groupe ayant pour objectif la production d'un aliment fermenté et caractérisation de sa qualité sanitaire selon différentes conditions de fabrication choisie. L'analyse microbiologique du produit alimentaire sera réalisée depuis l'étude des critères réglementaires et des méthodes normalisées jusqu'à sa mise en pratique et permettra de conclure quant à sa qualité sanitaire. Voir le cours
UC3-04-Construction raisonnée de l'aliment par la chimie et le procédé_2024-25 APT_2118_UC3_04_2024_25 - Mettre en oeuvre les différents procédés adaptés à l'élaboration de produits alimentaires. - Identifier et de mettre en oeuvre les méthodes analytiques permettant d'accéder à la composition des aliments (extraction, fractionnement des molécules, identification, dosage) ;- Choisir et utiliser les outils d'observation et de mesure des marqueurs d'intérêt au cours et/ou en fin d'opération, de façon à accéder à l'évolution de la composition des aliments au cours de leur transformation. - Faire le lien entre la composition des aliments, les procédés de transformation et les propriétés fonctionnelles désirées : organoleptique et nutritionnelles. Voir le cours
UC3-01-Initiation à la biologie de synthèse_2024-25 APT_2119_UC3_01_2024_25 Génomique et post-génomique. Rappel sur les méthodologies de séquençage et d'analyse des génomes. Approches globales du fonctionnement des génomes : transcriptome, protéome, métabolome, interactome, … Introduction à la biologie des systèmes. Flux métaboliques et MCA. Différents types de modélisation (métabolique vs cinétique) Approches « top down » vs. « bottom up ». Biologie de synthèse et biotechnologie. Illustration des différentes approches par des travaux pratiques en biologie de synthèse et des visites de laboratoires à l'INRA de Jouy-en-Josas. Située en aval de l'UC Biologie Intégrative, cette UC a été pensée pour être complémentaire en apportant un volet appliqué via des aspects d'ingénierie métabolique et de biologie de synthèse. Voir le cours
UC3-02-Biodiversité et évolution_2024-25 APT_2120_UC3_02_2024_25 Histoire des idées sur l'évolution, La génétique écologique, L'apport des molécules, Sélection et neutralité, Le gène égoïste, Le finalisme revisité, L'évolution du génome, Conflits et niveaux de sélection, Les contraintes dans l'évolution, La théorie des jeux appliquée à l'évolution, L'évolution du sexe, La sénescence et la mort, La sociobiologie, L'origine de la vie et la biologie synthétique.L'UC alterne les conférences par les enseignants ou des intervenants extérieurs avec des moments de débat d'idées et d'échanges collectifs.  Voir le cours
UC5-26-Milieux humides : définitions, réglementation et gestion_2024-25 APT_2121_UC5_26_2024_25 Les milieux humides sont abordés sous différents angles : définitions, fonctions et services écosystémiques ; fonctionnement hydrologique et/ou géochimique et/ou pédologique ; fonctionnement biologique et biodiversité ; habitats naturels.Remarque importante : l'unité propose une découverte des milieux humides par la règlementation qui régit la gestion de ces milieux ; l'UC5-26 ne se focalise pas sur les milieux littoraux et ultra-marins. Voir le cours
UC1-30-Économétrie : comment mesure-t-on les enjeux socioéconomiques de notre temps ?_2024-25 APT_2126_UC1_30_2024_25 L'économétrie est un outil utilisé par les économistes afin d’explorer les grands enjeux sociaux et économiques de notre temps, en établissant des liens entre différents phénomènes.  On trouve, parmi ces recherches, des travaux originaux mesurant par exemple, les effets du commerce international sur le changement climatique, les effets de l’éducation et du revenu sur la prévalence de l’obésité, les effets des politiques en faveur de l’avortement sur la baisse de la criminalité, ou encore les effets de l’immigration sur la croissance économique.L’analyse économétrique est aujourd’hui une compétence qui dépasse le monde de la recherche en économie. Elle est en effet de plus en plus utilisée dans la sphère professionnelle au rythme où la disponibilité des données s’accroit et que le marché de l’analyse de données fleurit. On pense notamment au poste de data analyst et autres activités de consultances. Voir le cours
UC3-12-Ingénierie cellulaire expérimentale_2024-25 APT_2128_UC3_12_2024_25 Ce module illustrera les potentialités de l'ingénierie cellulaire et les mécanismes biologiques sous-jacents :Analyse de l'expression de gènesImpact du génotype sur le phénotypeClonage d'un gène et mutagenèse dirigéeGénomique fonctionnelleLa maîtrise de ces outils sera illustrée par des travaux expérimentaux qui constitueront une large part dans le module.Le module comprend excusivement du travail expérimental et bibliohgraphique.Il se déroule sur deux sites, une semaine sur chaque site :site 1 : AgroParisTechsite 2 : INRAE de Versailles. Voir le cours
UC4-01-Aide aux choix pour l'emballage et le conditionnement des produits alimentaires et cosmétiques_2024-25 APT_2137_UC4_01_2024_25 Présentation de l'emballage et des fonctions à prendre en considération dans le développement d'un emballage (1h30) Etude du couple emballage/produit alimentaire et cosmétique : Présentation des différents matériaux (5*1h30), Contraintes sécurité et environnement (2h), Définition d'un cahier des charges fonctionnels et Etude Cas concrets (9-12h),Etude du couple emballage/machines : Techniques de conditionnement (2h), Gestion d'atelier de conditionnement (2h) et visite de site (conditionnement ou production emballage) dans la mesure du possible. Voir le cours
UC4-03-Analyse statistique de données environnementales_2024-25 APT_2138_UC4_03_2024_25 Modélisation hiérarchique bayésienne :principeheuristiquedémarche pratique.Elaboration de modèles en :dynamique de population,pour la prévision temporelle,pour des données spatiales,pour des données multiples à différentes échelles. Voir le cours
UC4-05-Changement climatique et chimie_2024-25 APT_2139_UC4_05_2024_25 Cours sur les mécanismes de l'effet de serre : spectroscopie des gaz de l'atmosphère et bilan thermique en découlant. Présentation des modifications des cycles biogéochimiques par l'augmentation des températures Conférence sur divers points par exemple : conséquences météorologiques ; remodelage du paysage agricole ; faune marine, etc. Voir le cours
UC4-07-Écologie urbaine_2024-25 APT_2140_UC4_07_2024_25

Principales contraintes environnementales du milieu urbain (sols, climat, qualité de l'air,...)

Rôle et place des infrastructures vertes en milieu urbain

Biodiversité, services écosystémiques en milieu urbain

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UC4-10-Initiation aux métiers de la recherche_2024-25 APT_2146_UC4_10_2024_25

Le monde de la recherche constitue un levier fondamental de l’innovation et du progrès dans de nombreux secteurs d’activité. Cette unité de cours vise à offrir une première immersion dans cet univers en explorant les métiers de la recherche, tant dans le domaine public que privé.

À travers une approche pluridisciplinaire, les étudiants découvriront les principaux enjeux et débouchés de la recherche dans des secteurs variés tels que la santé, l’alimentaire et l’environnement. Des professionnels issus de ces domaines viendront partager leur expérience, offrant ainsi un éclairage concret sur les parcours et opportunités existants.

L’unité de cours mettra également en lumière les ponts entre recherche et entrepreneuriat, en mettant en avant les initiatives et innovations issues des laboratoires. 

Enfin, une visite exceptionnelle du synchrotron SOLEIL au CEA permettra aux étudiants d’approcher de près une infrastructure scientifique de pointe et de mieux comprendre son rôle dans la recherche actuelle.

Cet enseignement a pour objectif de susciter la curiosité, de mieux appréhender les différents métiers de la recherche et d’ouvrir des perspectives professionnelles variées aux étudiants.

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UC4-23-La gestion et le traitement des données par l'apprentissage de VBA pour EXCEL_2024-25 APT_2158_UC4_23_2024_25 Ce module s'articule autour de deux périodes organisées séquentiellement et ayant des finalités pédagogiques distinctes.La première séquence propose un apprentissage progressif du langage VBA autour de trois thèmes : (a) les types et instructions élémentaires, (b) la fonction, unité de programmation et (c) la compilation et le débogage.La deuxième séquence comporte la réalisation, en binôme, d'un mini projet en Excel VBA, qui permet aux étudiants la mise en pratique des connaissances acquises. Voir le cours
UC5-01-Additifs et arômes alimentaires_2024-25 APT_2162_UC5_01_2024_25 Cette unité d'enseignement pose la question de l'utilisation des additifs et des arômes dans l'élaboration des produits alimentaires : panorama général des additifs et arômes disponibles, stratégies d'utilisation dans les aliments, sources / technologies de production /mise en œuvre sur quelques exemples, règlementation, question du clean label et des aliments ultra-transformés, intégration des problématiques des consommateurs, communication vers différents publics, etc. Voir le cours
UC5-02-Apport de l'épidémiologie à la maitrîse des risques sanitaires_2024-25 APT_2163_UC5_02_2024_25 Démarche épidémiologiqueEpidémiologie analytique (Association, confusion, enquêtes).Impacts des épidémiesEpidémiosurveillanceGestion des épidémiesModélisation des processus épidémiologiques.Présentations de cas d'étude ou de méthodes spécifiques Voir le cours
UC5-04-Construire la complexité en biologie_2024-25 APT_2165_UC5_04_2024_25 Parmi les thèmes abordés: biogenèse des organites cellulaires, polarité et différenciation, modèles cellulaires et lignées, neurobiologie, cellules cancéreuses, cellules souches, dialogue immunitaire, développement du système immunitaire, biotechnologies cellulaires. la plupart des exemples sont empruntés à la biologie humaine. Voir le cours
UC5-09-Du sauvage au domestique : évolution, places et rôles de l'animal dans nos sociétés_2024-25 APT_2168_UC5_09_2024_25 Depuis près de 15 000 ans les humains, au travers de l'acte domesticatoire, ont profondément modifié la constitution génétique tant des populations animales domestiques que celle des populations sauvages. Au cours de cette séquence d'enseignement, nous étudierons l'évolution des populations animales tout au long de la domestication à la lumière des concepts et des outils permettant de comprendre cette évolution, tout à la fois dans le passé, mais aussi actuellement (notamment à travers la gestion de la diversité) Voir le cours
UC5-19-Milieu périurbain : agriculture et aménagement de l'espace_2024-25 APT_2173_UC5_19_2024_25 Le module aborde la question par 4 ensembles :I) Cours:conférences Les cours/conférences apportent des connaissances en s'appuyant sur des exemples en France mais aussi au niveau international :1) Introduction : Qu'est ce que l'agriculture périurbaine ?2) Planification, réglementation : - Outils nationaux d'urbanisme et de planification : PLU, SCOT, PADD, ZAP, PAEN, PRIF, et l'exemple de l'IDF avec le SDRIF et la notion de d'analyse fonctionnelle. - Intégration de l'agriculture dans la planification des villes au niveau international - Politiques agricoles locales en périurbain3) Agriculture périurbain et environnement - Notions de base sur le paysage, trame verte et bleu - Valorisation des déchets des villes en agriculture périurbaine, comparaison entre Nord et Sud de la méditerranée4) Agriculture périurbaine et la fonction d'alimentation de la ville - Exemples français et internationaux (circuits courts, agriculture urbaine, ...)II) Une table ronde Des exemples de métiers d'ingénieur autour de l'agriculture périurbaine, fonctions et exemples d'actions (Chambre d'agriculture, Associations, projet Agri-urbain, Collectivités territoriales, ...)III) Etude de cas avec du terrainLes étudiants rencontreront trois à quatre acteurs locaux (agriculteurs, élus, ingénieurs, etc..), par groupe, répartis sur plusieurs territoires (4 territoires pour 32 étudiants). Les informations collectées sur les différents territoires seront ensuite croisées pour instruire quatre thèmes :Thème 1 : Coexistence spatiale agriculture-ville : la question du foncier, de la circulation et de l'accès aux champs.Thème 2 : L'agriculture, cadre de vie et identité du territoire.Thème 3 : Agriculture et fonction d'approvisionnement alimentaire du territoire.Thème 4 :Territoire périurbain et diversification des activités et du métier de l'agriculteur.Pour alimenter le travail sur les quatre thèmes les étudiants s'appuieront sur les cours/conférences, la table ronde, la bibliographie et les informations collectées sur le terrain. Aussi chaque territoire illustrera plus particulièrement l'une des thématiques, même si tous les thèmes sont plus ou moins présents sur chaque territoire. Evaluation Compte rendu écrit des travaux par groupe sur les territoiresPrésentation orale et rapport sur les travaux par thème de l'étude de cas Voir le cours
UC5-17-Les semences : de la biologie à la filière_2024-25 APT_2175_UC5_17_2024_25 A - Connaître la semence : Physiologie et biochimie du développement des semences ; Le processus germinatif ; Pathologies des semences.B - La filière-semences et la qualité : Production, préparation, conditionnement et conservation des semences ; La mise en place de la qualité des semences ; Le contrôle de la qualité des semences, les règles internationales d'essais de semences.C - Economie des productions de semences : Les semences dans le monde et la filière française ; Enregistrements des variétés et protection des semences ; Le marketing dans le secteur semences Voir le cours
UC3-21-Faune sauvage, Forêt et Milieux naturels : interactions et gestion multifonctionnelle_2024-25 APT_2177_UC3_21_2024_25 Cette unité aborde la problématique générale des interactions entre les animaux et les végétaux dans le cadre de la gestion multifonctionnelle du territoire et plus spécifiquement des écosystèmes naturels ou peu anthropisés (forêts, prairies naturelles, ripisylves...). Des connaissances sur la biologie (cycles de développement) et le comportement des principales espèces de la faune sauvage seront apportées (ongulés sauvages : chevreuil, cerf, sanglier ; grands prédateurs : loup, lynx ; autres : castor). Les interactions complexes (positives ou négatives) faune/espèces végétales dans ces milieux seront analysées à différentes échelles spatiale et temporelle. Une attention particulière sera portée en milieu forestier avec le diagnostic et l'analyse des symptômes et des dégâts sur les arbres et les conséquences pour la gestion (aussi bien animale que forestière). Concernant la faune sauvage, les aspects réglementaires seront également abordés (gestion cynégétique et chasse). Les dynamiques animale et végétale seront également analysées en regard des différents enjeux sociétaux concernant les milieux naturels et le maintien de la biodiversité, les évolutions des pratiques de gestion, les changements climatiques... Cette UC n’abordera pas les aspects de la domestication, de la sélection (naturelle ou non) et des conséquences sur les sociétés humaines (voir UC5 « du sauvage au domestique : évolution, places et rôles de l’animal dans nos sociétés). Voir le cours
UC5-10-Elaboration de la structure des produits alimentaires et formulation_2024-25 APT_2179_UC5_10_2024_25 Approche de type science des matériaux sur différents systèmes dispersés. Seront abordés : les gels, les solutions épaissies, les émulsions, les mousses, les milieux pulvérulents, les suspensions, les systèmes cristallisés, la transition vitreuse. Ces différents sujets permettront d'aborder la structure aux différentes échelles des systèmes dispersés et leur stabilité, les propriétés des interfaces, les phénomènes de changements d'état, les relations structure / propriétés et les méthodes de caractérisation associées. La visée générale est de donner des éléments de compréhension nécessaires à la formulation et l'élaboration de la structure et de la texture des produits. Voir le cours
UC5-23-Pollutions atmosphériques_2024-25 APT_2182_UC5_23_2024_25 Notions de base : description des principaux polluants atmosphériques et des outils méthodologiques nécessaires à leur étude (météorologie, etc.)Impacts des polluants atmosphériques sur la santé humaine, sur les agrosystèmes et sur les écosystèmes.Outils de surveillance et de biosurveillance de la qualité de l'air Organisation de la surveillance de la qualité de l'air en France et en Europe - Politiques de lutte contre les pollutions mises en place Voir le cours
UC5-21-Mode de production, santé animale et qualité des produits animaux_2024-25 APT_2183_UC5_21_2024_25 Les thèmes suivants seront abordés :1- Le mode de production influence-t-il la qualité organoleptique et nutritionnelle des produits animaux?2- Les productions sous cahier des charges (marques, SIQO) sont-elles des moyens de répondre aux questionnements actuels ?3- Quels ont été les impacts des différentes crises sanitaires sur les différents acteurs des filières animales et quelles ont été les réponses et les mesures associées ?4- Existe-t-il un lien direct entre la santé animale et les qualités des produits animaux?5- Quelles peuvent être les méthodes alternatives actuelles à l'allothérapie pour gérer la santé animale tout en préservant la qualité des produits ? Voir le cours
UC6-04-Comment la physique approche la complexité_2024-25 APT_2186_UC6_04_2024_25 Concepts clés de la physique du 20ème et du 21ème siécle illustrés par des exemples historiques et des situations de tous les jours- le problème des 3 corps : le système solaire est-il stable ?- le modèle simplissime de méteo de Lorentz- la simultanéité des impacts de foudre sur un train- le chat de Schrödinger- l'apparition de structures auto-organisés de Benard et de Taylor- l'électron qui passe dans deux orifices à la fois (interférence)- le paradoxe EPR- l'onctuosité de la crème glacée - le moelleux du pain - les gouttes de rosée sur une feuille Voir le cours
UC6-05-Concilier sauvage et domestique sur le territoire_2024-25 APT_2187_UC6_05_2024_25 Depuis 50 ans, le développement de l'agriculture et l'intensification de la production ont profondément modifié les écosystèmes avec, comme conséquence, une dégradation globale des services écosystémiques et un déclin de la biodiversité.  Dans ce contexte, des alternatives existent pour un mode de production plus respectueux de l'environnement et permettant la cohabitation entre faune sauvage et activités agricoles, dont l'élevage. Voir le cours