Cours
39036 Cours
| Nom complet | Nom abrégé | Résumé | |
|---|---|---|---|
| Mon_BioGET_SIG-Cours en ligne SIG (UE supplémentaire)_2024-25 | APT_20305_Mon_BioGET_SIG_2024_25 | Initiation aux SIG pour des écologues | Voir le cours |
| Ath-AGROPT22-AGROPT22 Animals in Science: Today's Challenges_2024-25 | APT_2036_Ath_AGROPT22_2024_25 | This unit is in English.
Livestock farming faces many scientific challenges, as do its professionals. |
Voir le cours |
| Ath-AGROPT23-AGROPT23 - Nutrition en Conditions Extrêmes_2024-25 | APT_2037_Ath_AGROPT23_2024_25 | Les thèmes suivants seront abordés :Dynamique digestive et mise à disposition des nutriments (monogastriques, polygastriques)Nutrition et efforts (chiens de traîneau, sportifs de haut niveau, treck....)Epargne et déposition musculaire : statégies alimentaires. Adaptation à une production intense (production laitière)Adaptation à la sous alimentation (sous alimentation dans les zones desertiques, jeûnes, ...). Alimentation en autonomie (raids longue durée, vol spatial, ....) | Voir le cours |
| UC1-05-Biologie intégrative, introduction à la complexité du vivant_2024-25 | APT_2066_UC1_05_2024_25 | Contenu de l'enseignement :Introduction module et bases de l'intégration en biologie + distribution d'articles (cours),Génomique appliquée à la sélection animale (cours),Intégration en ecophysiologie (cours),Approche de mesure des flux métaboliques chez l'homme (cours & TD),Intégration et modélisation réseau métabolique des microorganismes (TD),Acquisition image confocale (démonstration) et analyse d'image chez les plantes (TD),TD : De l'image au modèle statistique - exemple de reconstruction 3D d'une cellule et de ses compartiments,TD : Intégration transcriptome et protéome chez la plante, 9- Approches intégrées en biotechnologie végétale (cours) | Voir le cours |
| UC2-25-L'atmosphère : milieu d'échanges, de transports et de régulations_2024-25 | APT_2070_UC2_25_2024_25 | L'enseignement est fondé sur les connaissances déjà acquises en 1A. Il approfondit les connaissances des étudiants sur la turbulence, sur les échanges végétation-atmosphère et leur régulation ainsi que sur les couplages existants entre biologie et physique de l'environnement. On introduira également les étudiants à la résolution numérique des problèmes d'écoulement et de transfert. Si le mini-projet , fil conducteur de la pédagogie du module reste essentiellement concentré sur des problématiques à l'échelle locale, la circulation atmosphérique générale et les problèmes soulevés par l'effet de serre additionnel seront le cadre de conférences réalisées par des spécialistes de ces questions actuelles. Elles illustreront les mécanismes physiques décrits en cours à une échelle plus globale. | Voir le cours |
| UC1-09-Dendrométrie, croissance et production des peuplements forestiers_2024-25 | APT_2073_UC1_09_2024_25 | L’UC vise à fournir les bases nécessaires aux métiers de la gestion forestière en termes de biométrie forestière (caractérisation quantitative de l'arbre, du peuplement, et du massif forestier) et de caractérisation des peuplements forestiers et de leur dynamique (concepts, méthodes, modèles).Caractérisation dendrométrique de l'arbre : diamètre, hauteur, forme et volume. Définitions des grandeurs, appareils et méthodes de mesure, analyse et précision des mesures, estimation indirecte par tarif de cubage. Caractérisation dendrométrique des peuplements : densité, surface terrière, volume, hauteur dominante. Analyse de données d'inventaire forestier et calcul de la précision des estimations.Caractérisation du système étudié avec les niveaux peuplement et arbre. Développement de l'arbre. Phénomènes et processus dynamiques à l'échelle de l'arbre et du peuplement. Concepts et méthodes d’évaluation de la production. Changements de productivité. Approches de modélisation de la croissance forestière. | Voir le cours |
| UC1-02-Analyse économique_2024-25 | APT_2074_UC1_02_2024_25 | AVERTISSEMENT: pour l'année 2024/25, ce cours sera ouvert à la fois sous forme classique et en "classe inversée". Pour la plupart des cours ayant lieu le matin les étudiants auront le choix de suivre en présentiel ou de travailler chez eux des vidéos de cours pré-enregistrées. Seuls certains cours seront assurés de manière classique. L'après midi des applications de ces cours autour de TD ou de problèmes concrets seront ensuite enseignées en présentiel, dans une démarche participative.Ce module combine des séances de cours fondamentaux en microéconomie, des travaux dirigés et des conférences thématiques qui portent sur l'utilisation concrète des outils de l'économie. Des intervenants expliquent comment ils utilisent au quotidien des concepts présentés en cours, à la fois dans l'administration, dans les institutions financières privées et dans la recherche universitaire. Le cours est généralement assez formalisé, mais ne requiert que des connaissances minimales en mathématiques - Microéconomie (consommateur, producteur, séance d'exercice, programmation linéaire) - Economie publique (optima, inefficacité d'un marché en présence d'externalités, de biens publics, de concurrence et d'information imparfaite) - Etude de cas en économie de l'environnement et en politique agricole - Economie internationale: étude de cas dans les négociations internationales - Politique de la concurrence - Analyse économique de la déforestation. | Voir le cours |
| UC1-04-Bioingénierie des protéines et applications industrielles_2024-25 | APT_2075_UC1_04_2024_25 | Le programme comporte des cours, des conférences, des TP et TD sur les méthodes d'études structurales des protéines et sur diverses applications, illustrés par une visite d'entreprise pharmaceutique.- COURS ET CONFERENCES - Méthodes d'étude expérimentales des structures tridimensionnelles des protéines (radiocristallographie, résonance magnétique nucléaire, cryomicroscopie électronique, spectrométrie de masse), prédiction informatique des structures 3D protéiques. Relations structure-activité - Exemples d'applications industrielles: enzymes (agroalimentaire, détergents, textile), inhibiteurs de sialidases contre la grippe, laccases fongiques et dépollution, vaccinologie sructurale. - Développement d'une start-up biotechnologique, dépôt de brevets. - TRAVAUX PRATIQUES ET TRAVAUX DIRIGES - Initiation à la cristallographie des protéines (lysozyme). - VISITE : - Centre de Recherches Sanofi-Aventis, Département de biologie structurale, Vitry-sur-Seine | Voir le cours |
| UC1-07-Ce que nous apprennent les génomes_2024-25 | APT_2076_UC1_07_2024_25 | La génétique des populations humaines - La polyploïdie et l'évolution des éléments transposables - L'évolution du génome des plantes - La phylogénie moléculaire - Les processus de spéciation - Génétique des populations et signatures de sélection - Epigénétique/épigénomique - Réseaux de régulation des gènes - Innovations biotechnologiques et édition de génome - Cellules souches - Génomique, science et société. Panorama des méthodes de séquençage incluant les projets de séquençage de génomes complets et les NGS (Next Generation Sequencing) - Présentation des bases de données existantes - Interrogation des bases de données. Les applications en biomédecine et agronomie. Métagénomique et microbiote. | Voir le cours |
| UC5-27-Communication Nutrition-Santé sur les produits alimentaires_2024-25 | APT_2077_UC5_27_2024_25 | La qualité nutritionnelle et de santé des aliments commercialisés fait l'objet d'une forte attention par le consommateur. De nombreux produits (aliments courants ou compléments alimentaires) suggèrent ou revendiquent un intérêt nutritionnel et/ou un bénéfice pour la santé du consommateur et cette communication est au coeur d'enjeux importants. Les enjeux de la communication nutrition-santé se trouvent au croisement de la science nutritionnelle, en essor, des règles du Droit, en mutation, et des velleités d'innovation et de positionnement du secteur marchant. Cette UC aborde donc ce sujet de façon interdisciplinaire, et par des approches par l'objet. | Voir le cours |
| UC1-12-Food safety and risk analysis through the food chain_2024-25 | APT_2078_UC1_12_2024_25 | Since the '90s awareness about food safety among consumers has increased, while the standards and progress in conservation and traceability could suggest the disappearance of this type of problem. The word "chemical hazard" sounds still bad, as shown by the recent case "Fipronil eggs contamination" and mass media often contribute to an exaggerated perception of the real hazards. In this context, it seems necessary to provide a better knowledge of the relationship between modes of production and processing of agricultural commodities and food safety for humans. How can we objectively assess the impact of exogenous, endogenous and newly formed contaminants? How regulation (at French, European and global levels) allows it to protect consumers' health while providing a modern industrial production and fair trade rules? The aim of this module is to give the principles of risk analysis steps (assessment, management, communication) throughout the whole food chain in order to provide valuable tools to control and solve critical cases. An engineer familiar with the principles of assessment and control of chemical risks possesses precious tools for managing and controlling critical cases. Within this course, we will mobilize study cases illustrating similarities and differences existing between food industries regarding risk management. | Voir le cours |
| UC1-14-Localisation des productions animales : dynamiques et déterminants_2024-25 | APT_2080_UC1_14_2024_25 | Il s'agit de comprendre, au travers d'une présentation globale puis de quelques études de cas ou zoom, les évolutions passées et en cours des productions animales, à différentes échelles, et d'en comprendre les déterminants. | Voir le cours |
| UC1-10-Diagnostic des écosystèmes forestiers (DEF3)_2024-25 | APT_2081_UC1_10_2024_25 | Cette UE donne les principes et les bases du diagnostic des écosystèmes forestiers dans toutes les composantes (climat, sol, flore, peuplement). Elle associe des cours magistraux (21 h), des TD en salle (4,5 h) et des sorties à la journée ou la 1/2 journée (39 h). Elle s'étend de septembre à octobre. Le contrôle de connaissances se fait par un compte rendu de tournée, une présentation orale d'un cas d'étude, le rendu d'un herbier et un examen de dendrologieCette UE est indispensable pour suivre les autres UE notamment les enseignements en sylviculture, en écologie végétale, en gestion forestière ou des milieux naturels... | Voir le cours |
| UC1-16-Procédés Alimentaires : de la théorie à la pratique_2024-25 | APT_2082_UC1_16_2024_25 | Un grand nombre de procédés de transformation et conservation s’appuient sur des traitements thermiques par la chaleur (concentration par évaporation, séchage, cuisson...) ou par le froid (congélation, réfrigération, cristallisation...) et sur des opérations de séparations (filtration, cristallisation, distillation, échanges d’ions...). Ces procédés sont connus et existent pour la plupart à l'échelle de la cuisine, mais pour une utilisation à une échelle industrielle, ils nécessitent de savoir dimensionner et concevoir des procédés et de contrôler leur fonctionnement, le tout dans des conditions optimales de maîtrise de la qualité et d’impact sur l’environnement.Cet enseignement présentera le principe de quatre opérations unitaires de transformation (évaporation, séchage, filtration) et de conservation (refroidissement/ congélation) . Il s'appuiera sur les notions de bilans et transferts abordées dans l'UE Génie industriel des aliments et bioproduits. Puis pour chaque opération, il abordera les paramètres de dimensionnement, de choix technologiques possibles et de conduite appliqués à des exemples concrets. | Voir le cours |
| UC1-06-Biomolécules et synthons : de leur production par voie biotechnologique à leur extraction_2024-25 | APT_2083_UC1_06_2024_25 | La production de molécules fonctionnelles et de synthons par des voies biotechnologiques à partir des bioressources représente un potentiel particulièrement riche d'innovations et constitue une alternative aux procédés chimiques dans un souci économique et de respect de l’environnement. De part sa formation en lien avec le Vivant, le futur ingénieur AgroParisTech aura un rôle majeur à jouer dans ce domaine, tant en R&D qu'en production ou en conseil, auprès d'entreprises oeuvrant dans le domaine des industries pharmaceutiques et des entreprises en biotechnologies blanches, mais aussi auprès de petites start-ups. | Voir le cours |
| UC2-01-Adaptation des Plantes à l'Environnement_2024-25 | APT_2084_UC2_01_2024_25 | Un état des lieux : évaluation des pertes agronomiques et économiques causées par la sécheresse, la pollution, les maladies, la salinité, les métaux lourds, ...Exemples de programmes nationaux ou internationaux destinés à identifier des facteurs de résistance à des contraintes environnementales. Importance des ressources génétiques comme réservoirs de gènes de rusticité et d'adaptation. Intérêt des programmes de génomique pour identifier les bases génétiques de la résistance aux stress biotiques et abiotiques. Que pourraient apporter les plantes transgéniques ?Etude de mécanismes physiologiques et biochimiques clés responsables de la résistance aux biotiques et abiotiques.Visite de sites travaillant sur l'étude de la tolérance et l'adaptation des plantes aux stress biotiques et/ou abiotiques. | Voir le cours |
| UC2-14-La recherche en agronomie et agroécologie_2024-25 | APT_2086_UC2_14_2024_25 | Les évolutions des agricultures nécessitent, outre des actions politiques et économiques, la production de connaissances nouvelles sur le fonctionnement des agroécosystèmes, et de méthodes pour mettre au point des systèmes agricoles innovants. C'est le propos de la recherche en agronomie (au sens de la discipline Agronomie, donc s'intéressant aux systèmes fondés sur des productions végétales) et agroécologie (qui replace ces systèmes dans des ensembles plus globaux), pour laquelle il existe un regain d'intérêt. | Voir le cours |
| UC1-19-Behaviour and Neurobiology_2024-25 | APT_2088_UC1_19_2024_25 | Basic knowledge on some of the following topics (may vary from year to year): * History of the study of behaviour and the different approaches * Neural structures, neuropharmacology, muscular system and neural commands * Behavioural development * Stimuli and communication * Learning and memory * Motivation, emotion, stress * Evolution and behaviour * Social organisationApplications of the study of behaviour : * Behaviour and animal husbandry in the context of the evaluation of animal welfare * Behaviour of insect pests and parasites and using this knowledge for crop protection | Voir le cours |
| UC2-02-Agro-ressources : stratégies de valorisation par voie biologique et chimique_2024-25 | APT_2091_UC2_02_2024_25 | La valorisation des resources agricoles en molécules et matériaux passe par la mise en ouvre de procédés de fractionnement du matériel végétal et par la conversion biologique et/ou chimique des constituants permettant d'obtenir les structures ou fonctions recherchées. En vue de pouvoir concevoir et développer de nouvelles voies de valorisation, il est nécessaire de comprendre le principe, les avantages et les limites des outils biologique et chimiques à disposition pour effectuer ces transformations. La chimie « éco compatible » est une démarche visant à réduire ou éliminer l'usage ou la formation de substances dangereuses et/ou toxiques dans la conception, la production et l'utilisation des produits chimiques. L’utilisation de ressources renouvelables constitue l’un des 12 principes de cette chimie « propre ». | Voir le cours |
| UC2-04-Bioéthique et Biovigilance_2024-25 | APT_2092_UC2_04_2024_25 | Les principes philosophiques. Les lois de bioéthique. L'éthique dans l'exploration spatiale - La recherche sur les gènes, cellules, organes/organoïdes - l'édition du génome - Les cellules souches - Le don d'organes - La médecine prédictive - La recherche biomédicale et l'éthique de la recherche sur l'homme - L'éthique des expérimentations animales - La brevetabilité du vivant - Les neurosciences - L'agence de biomédecine. | Voir le cours |
| UC2-05-Biotechnologies animales_2024-25 | APT_2093_UC2_05_2024_25 | Biotechnologies du génome : génomique structurale et fonctionnelle, transcriptomique, protéomique - présentation, applications et limites de ces approches à haut débit.Biotechnologies de la reproduction : transplantation embryonnaire, fécondation in vitro, sexage, clonage, transgenèse animale.Biotechnologies des aliments et de la nutrition, conséquences pour la qualité des produits animaux et la sécurité du consommateur.Etat des lieux et marché actuel de ces biotechnologies.Bioéthique, brevetabilité du vivant, acceptation sociale. | Voir le cours |
| UC2-09-Economie et gestion de la santé_2024-25 | APT_2095_UC2_09_2024_25 | Plusieurs difficultés ont émergé ces dernières décennies dans le domaine de la santé (déficit du secteur de la santé, gestion de la sécurité sanitaire). Ainsi, l'analyse de l'efficacité et l'efficience économique du système de santé ainsi que le management du secteur de santé et ses risques deviennent essentielles.Ce cours s'adresse aux étudiants intéressés par les métiers touchant au secteur de la santé : postes de cadre, contrôleur de gestion, manager ou chargé de mission dans les organisations du secteur de la santé (publiques ou privées, à finalité économique ou non), organisations sanitaires (hôpitaux, cliniques), organisations médico-sociales (établissements d'hébergement des personnes âgées dépendantes, institutions d’accueil des personnes handicapées...), structures associatives œuvrant dans le domaine de la santé…, dans les établissements dont l’activité est liée au bien-être et à la santé (établissements thermaux, instituts de thalassothérapie, spas, entreprises de cosmétiques, entreprises de luxe…), dans les instances de tutelle ou de régulation de ces organisations (ARS, Conseils Généraux...). | Voir le cours |
| UC2-15-Mécanismes et évolution de la pathogénie : interactions cellulaires_2024-25 | APT_2097_UC2_15_2024_25 | Introduction à la biologie et à l'écologie des pathogènes : bactéries, virus, champignons et autres parasites. Défenses immunes de l'homme et des plantes vis-à-vis des agents infectieux. Mécanismes de la pathogénie, détournement des fonctions cellulaires et en particulier du système immunitaire. Ecologie des interactions microbe-animaux, microbes-plantes. Techniques d'étude des mécanismes de pathogénie des microbes. Génétique et évolution de la pathogénie, transferts de l'information génétique, évolution des structures. Coût social des maladies infectieuses, moyens de lutte. | Voir le cours |
| UC2-17-Méthodes et outils d'analyse spatiale et de diagnostic sylvicole_2024-25 | APT_2098_UC2_17_2024_25 | SIG : cours et TD permettant une utilisation de base des systèmes d'information géographique et des GPS (acquisition et navigation).Application de ces connaissances (et de celles déjà abordées dans d'autres UC du SCD1-forêt en sylviculture et dendrométrie) au cours d'un mini-projet de diagnostic de stations et peuplements forestiers à l'échelle d'un groupe de parcelles. | Voir le cours |
| UC2-19-Microbiologie alimentaire_2024-25 | APT_2099_UC2_19_2024_25 | Cette UC s'intéresse à deux aspects de la microbiologe alimentaire: les microorganismes d'intérêt alimentaire appelés également technologiques et les microorganismes indésirables (flore pathogène et flore d'altération).L'UC a pour objectifs de :- Montrer comment les fermentations sont utilisées pour obtenir un aliment avec des qualités sensorielles, nutritionnelles et sanitaires recherchées. A travers l'exemples de certains aliments fermentés, les microorganismes impliqués, leur dynamique de croissance, leur métabolisme seront présentés.-Présenter les principaux dangers microbiologiques avérés, suspectés ou émergents. Les démarches d'appréciation quantitative du risque (AQR) et de détermination d'une DLC seront abordées par l'étude de cas concrets.L'UC aura pour fil conducteur un projet de groupe ayant pour objectif la production d'un aliment fermenté et caractérisation de sa qualité sanitaire selon différentes conditions de fabrication choisie. L'analyse microbiologique du produit alimentaire sera réalisée depuis l'étude des critères réglementaires et des méthodes normalisées jusqu'à sa mise en pratique et permettra de conclure quant à sa qualité sanitaire. | Voir le cours |
| UC3-04-Construction raisonnée de l'aliment par la chimie et le procédé_2024-25 | APT_2118_UC3_04_2024_25 | - Mettre en oeuvre les différents procédés adaptés à l'élaboration de produits alimentaires. - Identifier et de mettre en oeuvre les méthodes analytiques permettant d'accéder à la composition des aliments (extraction, fractionnement des molécules, identification, dosage) ;- Choisir et utiliser les outils d'observation et de mesure des marqueurs d'intérêt au cours et/ou en fin d'opération, de façon à accéder à l'évolution de la composition des aliments au cours de leur transformation. - Faire le lien entre la composition des aliments, les procédés de transformation et les propriétés fonctionnelles désirées : organoleptique et nutritionnelles. | Voir le cours |
| UC3-01-Initiation à la biologie de synthèse_2024-25 | APT_2119_UC3_01_2024_25 | Génomique et post-génomique. Rappel sur les méthodologies de séquençage et d'analyse des génomes. Approches globales du fonctionnement des génomes : transcriptome, protéome, métabolome, interactome, … Introduction à la biologie des systèmes. Flux métaboliques et MCA. Différents types de modélisation (métabolique vs cinétique) Approches « top down » vs. « bottom up ». Biologie de synthèse et biotechnologie. Illustration des différentes approches par des travaux pratiques en biologie de synthèse et des visites de laboratoires à l'INRA de Jouy-en-Josas. Située en aval de l'UC Biologie Intégrative, cette UC a été pensée pour être complémentaire en apportant un volet appliqué via des aspects d'ingénierie métabolique et de biologie de synthèse. | Voir le cours |
| UC3-02-Biodiversité et évolution_2024-25 | APT_2120_UC3_02_2024_25 | Histoire des idées sur l'évolution, La génétique écologique, L'apport des molécules, Sélection et neutralité, Le gène égoïste, Le finalisme revisité, L'évolution du génome, Conflits et niveaux de sélection, Les contraintes dans l'évolution, La théorie des jeux appliquée à l'évolution, L'évolution du sexe, La sénescence et la mort, La sociobiologie, L'origine de la vie et la biologie synthétique.L'UC alterne les conférences par les enseignants ou des intervenants extérieurs avec des moments de débat d'idées et d'échanges collectifs. | Voir le cours |
| UC5-26-Milieux humides : définitions, réglementation et gestion_2024-25 | APT_2121_UC5_26_2024_25 | Les milieux humides sont abordés sous différents angles : définitions, fonctions et services écosystémiques ; fonctionnement hydrologique et/ou géochimique et/ou pédologique ; fonctionnement biologique et biodiversité ; habitats naturels.Remarque importante : l'unité propose une découverte des milieux humides par la règlementation qui régit la gestion de ces milieux ; l'UC5-26 ne se focalise pas sur les milieux littoraux et ultra-marins. | Voir le cours |
| UC1-30-Économétrie : comment mesure-t-on les enjeux socioéconomiques de notre temps ?_2024-25 | APT_2126_UC1_30_2024_25 | L'économétrie est un outil utilisé par les économistes afin d’explorer les grands enjeux sociaux et économiques de notre temps, en établissant des liens entre différents phénomènes. On trouve, parmi ces recherches, des travaux originaux mesurant par exemple, les effets du commerce international sur le changement climatique, les effets de l’éducation et du revenu sur la prévalence de l’obésité, les effets des politiques en faveur de l’avortement sur la baisse de la criminalité, ou encore les effets de l’immigration sur la croissance économique.L’analyse économétrique est aujourd’hui une compétence qui dépasse le monde de la recherche en économie. Elle est en effet de plus en plus utilisée dans la sphère professionnelle au rythme où la disponibilité des données s’accroit et que le marché de l’analyse de données fleurit. On pense notamment au poste de data analyst et autres activités de consultances. | Voir le cours |