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Nom complet Nom abrégé Résumé
BIOTECH_UE_CIEGB-Contrôle et ingénierie de l'expression des gènes bactériens_2024-25 APT_1831_BIOTECH_UE_CIEGB_2024_25 Le professionnel en Microbiologie Appliquée est amené à proposer des améliorations des techniques actuellement utilisées dans les industries mettant en oeuvre les fonctionnalités des microorganismes, de répondre aux questions et problèmes posés et de développer des nouvelles approches qui permettront d'augmenter l'efficacité des transformations.  Les avancées en biotechnologies nécessitent une compréhension des procédés et de la physiologie et biochimie des organismes, mais impliquent de plus en plus les disciplines de génétique moléculaire de génomique et post-génomique.Ce module se propose d'explorer la génétique des différents organismes d'utilité biotechnologique, de les comparer au niveau de leur génome et de leurs réseaux métaboliques afin d'étayer des stratégies d’optimisation pour une utilisation donnée. Un facteur important dans cette optique est le réseau de contrôle transcriptionnel, allant du promoteur du gène même aux interactions avec d'autres gènes du métabolisme, ce qui est l'un des facteurs les plus importants affectant le résultat d'une manipulation qui vise à améliorer une souche. Cet enseignement présentera donc les techniques actuellement disponibles pour l'analyse globale d'un microorganisme, se focalisant plus particulièrement sur la possibilité d’intervention dans des réseaux de régulation transcriptionnelle.Les modes pédagogiques sont des cours magistraux (choix d'organisme et de souche, modification et optimisation de la voie biosynthétique ; analyse, modélisation et interprétation d'un réseau de régulation.) auxquels est ajouté un composant important de TP.  L’objectif du TP est la création d’une banque de promoteurs synthétiques qui sera utilisée pour étudier les effets des changements de séquence sur le niveau d’expression d’un gène (celui codant une protéine d'intérêt biotechnologique). Au cours de ce TP, les étudiants construiront la banque des promoteurs synthétiques, dont ils détermineront les séquences, et mesureront le niveau d’expression des promoteurs par le biais d’un gène rapporteur associé.  Ils quantifieront le rendement de la protéine clonée par SDS-PAGE et par un essai d’activité de l’enzyme purifiée. Voir le cours
BIOTECH_UE_BCS-Biologie cellulaire et santé_2024-25 APT_1838_BIOTECH_UE_BCS_2024_25

L’objectif de cette UE est de montrer l’importance des études au niveau cellulaire et leurs applications en santé et dans l’industrie : compréhension de dysfonctionnements en lien avec des pathologies, développement de modèles cellulaires d’étude de molécules actives, bioproduction de médicaments.

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BIOTECH_UE_3B-Biomolécules, biomatériaux, bioénergies_2024-25 APT_1840_BIOTECH_UE_3B_2024_25 L’UE s’inscrit dans le contexte de l’essor mondial de la chimie verte en réponse à des enjeux socio-économiques, environnementaux et technologiques conduisant à exploiter la biomasse végétale pour la production de molécules et matériaux d’intérêt. Les biotechnologies constituent l’un des principaux leviers d’innovation dans ce secteur, à la fois pour l’optimisation de la qualité de la biomasse et pour la mise au point d’outils de bioconversion technologiquement performants et respectueux de l’homme et de l’environnement.Cette UE s’adresse à la fois aux étudiants souhaitant découvrir les applications des biotechnologies (végétales et industrielles) à la chimie verte et aux étudiants ayant déjà suivi une formation en bioraffinerie et chimie verte souhaitant acquérir une formation pratique en biochimie végétale et rencontrer des acteurs professionnels.L'UE, mutualisée entre la DA Biotech et le M2 BEB du Master européen Bioceb, offre par ailleurs une occasion de suivre un enseignement en langue anglaise dans un contexte interculturel. Voir le cours
BIOTECH_UE_CEMEX-Concepts et méthodes expérimentales en biotechnologie_2024-25 APT_1844_BIOTECH_UE_CEMEX_2024_25 Cet enseignement constitue le tronc commun de la DA BIOTECH. Il a pour but d'apporter, en début de formation, des bases communes aux biotechnologies, au travers de cours, de conférences, de visites et d'une séquence importante de travaux pratiques (45h). Voir le cours
NUTRI_UE_PHYNES-Physiologie de la nutrition et santé de l'homme_2024-25 APT_1853_NUTRI_UE_PHYNES_2024_25   Voir le cours
NUTRI_UE_SANDAL-Statistique et analyse des données appliquées à la nutrition et à la consommation_2024-25 APT_1854_NUTRI_UE_SANDAL_2024_25 Approches statistiques couramment utlisées en nutrition et en alimentation humaine: analyse de données (ACP, clsutering), modèles linéaires (ANOVA, modèle mixte en mesures répétées), régression logistique. L'UE se compose de cours de statistiques (1/3), de TD sur SAS(1/3) et de travail sur jeu de données réelles. Voir le cours
NUTRI_UE_EPINES-Épidémiologie nutritionnelle et santé publique_2024-25 APT_1856_NUTRI_UE_EPINES_2024_25 L'analyse des relations entre la consommation alimentaire et l’état de santé se conduit à plusieurs niveaux d'échelle (du nutriment au régime) et elle est indispensable à l'établissement des recommandations nutritionnelles de santé publique. Apprécier et caractériser les relations établies à l'échelle observationnelle et populationnelle requiert des méthodes pour l'évaluation des consommations alimentaires, l’analyse de l’état nutritionnel, et des approches analytiques épidémiologiques poussées. Voir le cours
NUTRI_UE_ICONS-Innovation et communication nutrition-santé_2024-25 APT_1857_NUTRI_UE_ICONS_2024_25  L'UE présente différents exemples d'intégration de la nutrition dans l'innovation et la communication des acteurs économiques du secteur de l'alimentation. Elle forme à quelques aproches et outils mise en oeuvre dans le domaine de l'innovation et de la reformulation. Elle présente les missions de l'ingénieur nutritionniste dans le secteur concurentiel Voir le cours
NUTRI_UE_CODALE-Comprendre le droit : exemples tirés des droits de l'alimentation et l'environnement_2024-25 APT_1858_NUTRI_UE_CODALE_2024_25  L'UE "Comprendre le droit: exemples tirés du droit de l'alimentation et du droit de l'environnement" a pour objectif de cerner les enjeux juridiques qui concernent les ingénieurs dans le domaine de l'alimentation et de l'environnement. Voir le cours
NUTRI_UE_ALLUM-Alimentation et lutte contre la malnutrition_2024-25 APT_1860_NUTRI_UE_ALLUM_2024_25  Près de la moitié de la population mondiale est concernée par les problèmes d'insécurité alimentaire et/ou de malnutrition. Insécurité alimentaire et malnutrition affectent le bien-être et la santé des individus et ont un fort retentissement sur les activités sociales et économiques des populations concernées. Cette UE présente les outils et méthodes permettant d'identifier les individus et populations affectées par ces situations ainsi qu'aux politiques et interventions mises en oeuvres pour les soulager. Voir le cours
NUTRI_UE_PROJ-Projet en nutrition humaine_2024-25 APT_1863_NUTRI_UE_PROJ_2024_25  Le projet d'ingénieur en nutrition humaine est un travail réalisé en binôme/trinôme de septembre à février sur une problématique proposée par un partenaire extérieur (entreprise, agence publique, organisation non-gouvernementale) et durant lequel les étudiants mobilisent les connaissances et savoir faire acquis durant leur formation au sein de l'établissement, en autonomie et sous la supervision d'un enseignant chercheur Voir le cours
_3A_NUTRI_STAGE-Stage de fin d'études_2024-25 APT_1865__3A_NUTRI_STAGE_2024_25  Le second semestre de la 3ème année du cursus ingénieur est constitué d'un stage de 6 mois qui constitue une première expérience d'ingénieur en situation.  Voir le cours
NUTRI_UE_DECOM-Déterminants des comportements alimentaires_2024-25 APT_1866_NUTRI_UE_DECOM_2024_25   Voir le cours
2ASIMM-STATS-Sciences des données : apprentissage statistique_2024-25 APT_1978_2ASIMM_STATS_2024_25 La première partie est consacrée à des méthodes d’apprentissage non supervisé afin d’aider à la manipulation et à la visualisation de données. Une méthode classique de statistiques exploratoires -- l’analyse en composantes principales -- et des méthodes de classification non supervisée telles que les k-means et la classification ascendante hiérarchique sont présentées dans cette première partie.La seconde et majeure partie est consacrée à des méthodes d’apprentissage supervisé afin de fournir des outils de modélisation et d’interprétation de données. Le modèle linéaire -- qui regroupe la régression linéaire, l’analyse de la variance à un et deux facteurs et l’analyse de la covariance --, la régression logistique et la méthode des k plus proches voisins sont présentés dans cette partie.Cette UE comporte des cours magistraux, des travaux dirigés et des TD informatiques sur le logiciel R. Voir le cours
2ASIMM-MMC-Mécanique des milieux continus_2024-25 APT_1979_2ASIMM_MMC_2024_25 Approche eulérienne des écoulements et transferts dans les fluides monophasiques newtoniens.Approche filaire.Introduction à des phénomènes plus complexes (sans introduction d'un formalisme général): matériaux multiphasiques et/ou anisotropes, approche multi-échelle, turbulence.Analyse et résolution de problèmes d'écoulement, de déformation et/ou de transfert par simulation numérique (approche filaire et approche 2D) sur des études de cas. Voir le cours
2ASESG-AN-FIN-Analyse financière_2024-25 APT_1982_2ASESG_AN_FIN_2024_25 Rappels comptablesRentabilitéSolvabilitéFinancementDémarche d'analyse financière et stratégie d'entreprise Voir le cours
2ASESG-EVAL-PROJ-Évaluation de projets (point de vue de la collectivité)_2024-25 APT_1984_2ASESG_EVAL_PROJ_2024_25 Les agents d'un projet et les contraintes macro-économiques des politiques de développementLes différences entre l'analyse financière et l'évaluation économiqueLa démarche générale de l'évaluation économiqueLa méthode des prix de référence Voir le cours
2A-D1P-UC2-QUALITE PROD-UC2 Palaiseau - Elaboration de la qualité des produits animaux et végétaux : approche physiologique_2024-25 APT_1987_2A_D1P_UC2_QUALITE_PROD_2024_25 UC 3.1 Contrôle hormonal de la croissance et de l'adaptation des plantesCours (6h) : Développement et qualité des semences ; Croissance de la feuille : une verrou hormonal ? (JD Faure); Croissance et adaptation des plantes aux contraintes environnementales (L Rajjou); Maturation et qualité de fruits ().TD (3h) : exploitation des ressources bioinformatiques pour la recherche de caractères d'intérêt chez les végétaux (L Rajjou,).TP (3h) : mutations et gènes rapporteurs pour la qualité des végétaux (JD Faure, )UC 3.2 Maîtrise de la qualité nutritionnelle, technologique et organoleptique des denrées animalesInfluence de l'alimentation et des conditions d'élevage sur la qualité des produits carnés (V. Berthelot)Facteurs de croissance et qualité de la viande (P. Schmidely)Génétique et Qualité - aspects moléculaires (T. Heams)4-Qualité des produits animaux-aspects institutionnels (C. Mariojouls)5- TD Formulation : Optimisation d'aliments pour monogastrique sur une composante de la qualité (V. Berthelot et coll.) Voir le cours
2A-D1P-UC4-SELEC ET GEST ESPEC-UC4 Palaiseau - Sélection et gestion de la diversité des espèces domestiques animales et végétales_2024-25 APT_1988_2A_D1P_UC4_SELEC_ET_GEST_ESPEC_2024_25 UC 4.1 L'amélioration des plantes vise à fournir aux agriculteurs des variétés adaptées aux conditions de culture, à l'environnement et aux marchés qui sont en perpétuelles évolutions. L'UC vise à fournir les éléments scientifiques, méthodologiques et réglementaires qui permettent la mise en marché de nouvelles variétés et le maintien de la capacité d'innovation.UC 4.2 L'amélioration génétique des animaux, au même titre que l'amélioration des conditions d'élevage et l'amélioration de l'efficacité de l'ensemble des filières de production, participe à l'amélioration des productions animales. La sélection, d'une race, d'une lignée, se raisonne à l'échelle de la population dans son ensemble et dans le cadre d'une organisation qui peut être collective, comme chez les ruminants ou bien privée, à l'exemple des volailles, les porcs se situant entre ces deux types. Voir le cours
2A-D1P-UC3- EPIDEMIOLOGIE-UC3 Palaiseau - Epidémiologie – Qualité sanitaire des produits végétaux et animaux_2024-25 APT_1989_2A_D1P_UC3__EPIDEMIOLOGIE_2024_25
Ce module sera organisé en deux sous thèmes : 
1) santé des plantes.;
2) qualité sanitaire des produits animaux.

Santé des plantes : Cet enseignement a pour objectif de faire connaître les bases biologiques des interactions plantes-bio-agresseurs (cycles infectieux, mécanismes d'infection, résistances). La connaissance des mécanismes de l'immunité des plantes est également abordée car elle constitue la base d'une part importante des méthodes de lutte alternatives aux produits phytosanitaires. L'épidémiologie qui sera abordée en intégrant les connaissances sur l'interaction hôte-pathogène à différents niveaux d'organisation et à différentes échelles spatio-temporelles, dispense une formation fondamentale pour répondre à des questions telles que : - la sélection et la gestion des résistances variétales pour assurer leur durabilité - la gestion des traitements phytosanitaires dans un objectif de prévention de l'apparition des résistances - la prévention des épidémies à différentes échelles spatiales. Les étudiants auront un apport de connaissances sous forme de cours, TD et de TP complémentaires des cours.

Qualité sanitaire des produits animaux : Cet enseignement contribuera à identifier certains contaminants liés à l'alimentation animale pour le consommateur et dont la présence a induit des crises sanitaires. Il initiera à l'utilisation de certains outils que l'ingénieur se doit de posséder pour acquérir des compétences concernant l'analyse de risques (modélisation, épidémiologie). Les aspects réglementaires concernant la gestion des risques en alimentation animale permettront de situer ces approches dans un contexte de pratiques de terrain.
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2A-D1P-UC5-SYST CULT ELEV ENVI-UC5 Palaiseau - Système de culture, système d'élevage et environnement_2024-25 APT_1990_2A_D1P_UC5_SYST_CULT_ELEV_ENVI_2024_25 - Evaluation des pratiques agricoles et conception de nouveaux systèmes de culture- Elevage, fonctions et environnement : éléments pour une analyse critique- Pratiques agricoles et services écosystémiques Voir le cours
2A-D1P-UC6-FILIERE-TERRITOIRE--UC6 Paris - Filières, territoires et société – Evaluation de la contribution au développement durable des systèmes de production_2024-25 APT_1991_2A_D1P_UC6_FILIERE_TERRITOIRE__2024_25 Deux enseignements composent cette UE :UC 6-1 : Filières, territoires et société (15 h) ;UC 6-2 : Évolution des systèmes de production et évaluation de leur contribution au développement durable (16,5 h). Voir le cours
2A-D1P-UC1-CARACT CHAMP CULTIV-UC1 Palaiseau - Caractérisation du champ cultivé ; Elaboration des constituants animaux_2024-25 APT_1992_2A_D1P_UC1_CARACT_CHAMP_CULTIV_2024_25 L'UC1 s'intéresse aux déterminants de la production agricole. Elle se décline en deux parties, l'une axée sur la production végétale (UC1.1), l'autre sur la production animale (UC1.2).UC 1.1 Caractérisation du champ cultivé. Rappels sur le principe et la méthode du diagnostic agronomique puis application à travers l'observation du profil cultural et la réalisation d'un diagnostic prairial à Grignon. Ouverture sur l'utilisation de ces méthodes.UC 1.2 Élaboration des constituants des denrées animales Mécanismes de la croissance du tissu adipeux et du muscle (déterminants nutritionnels et hormonaux). Relation entre alimentation et croissance animale. Modélisation mécaniste des phénomènes de la croissance. Cours sur la physiologie de la lactation. Voir le cours
2AD1N-DIAG ECOSYST-Diagnostic des écosystèmes forestiers (DEF1)_2024-25 APT_1994_2AD1N_DIAG_ECOSYST_2024_25 Cette UE donne les principes et les bases du diagnostic des écosystèmes forestiers dans toutes les composantes (climat, sol, flore, peuplement). Elle associe des cours magistraux (21 h), des TD en salle (4,5 h) et des sorties à la journée ou la 1/2 journée (39 h). Elle s'étend de septembre à octobre. Le contrôle de connaissances se fait par un compte rendu de tournée, une présentation orale d'un cas d'étude, le rendu d'un herbier et un examen de dendrologie (en salle, 1 heure).Cette UE est indispensable pour suivre les autres UE notamment les enseignements en sylviculture, en écologie végétale, en gestion forestière ou des milieux naturels... Voir le cours
2AD1N-ECOL GEST FOR-Écologie et gestion forestière_2024-25 APT_1995_2AD1N_ECOL_GEST_FOR_2024_25 Comportement des essences et conséquences sur la gestion forestièreCycles sylvi-génétiquesTraitements, conduite des principaux types de peuplements, définitions.Sylviculture sur deux domaines biogéographiques (Vosges et plateaux calcaires du Nord-Est); liens avec les potentialités du milieu et la dynamique comparée des essences.Application en forêt à l'étude de peuplements types.Ligniculture. Voir le cours
2AD1N-SYLVICULT-Sylviculture appliquée et principes d'aménagement_2024-25 APT_1998_2AD1N_SYLVICULT_2024_25 Sylviculture des chênaies et des douglasaies.Indicateurs économiques d'efficience de la gestion sylvicole.Aménagement forestier (principes).Martelage. Voir le cours
2A-D2-Domaine "ingénierie des aliments, biomolécules et énergie"_2024-25 APT_2000_2A_D2_2024_25
Le domaine 2 - ingénierie des aliments, biomolécules, énergie - recouvre trois principaux secteurs industriels :
- industries agro-alimentaires
- industries cosmétiques
- industries de production de biomolécules, matériaux et énergie à partir de biomasse
La carte d'identité du domaine 2 est la suivante :
- connaître la matière première
- observer, connaître et comprendre les mécanismes
- concevoir, calculer, définir et contrôler les produits et les procédés
- distribuer et gérer les produits, les entreprises, les projets- connaître, comprendre et interpréter les attentes des utilisateurs/consommateurs
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2AD2-UC1 SC ALIM-D2 -UC1 Sciences des aliments et bioproduits_2024-25 APT_2001_2AD2_UC1_SC_ALIM_2024_25 Cette unité d'enseignement propose une double approche de la relation structure/réactivité/fonctionnalité des aliments et bioproduits :une approche globale mettant en évidence les interactions qui existent au sein d'un aliment ou d'un bioproduit, entre les molécules (macro- et micro-constituants), les réactions, les mécanismes de structuration et la construction des propriétés, en insistant sur la complexité de ces milieux ;une approche par ingrédients, permettant d'appréhender leur production et leurs fonctionnalités en lien avec les problématiques de conception et développement de produits, dans un contexte de transition alimentaire. Voir le cours
2AD2- UC2 GENIE DES PROCEDES-D2 - UC2 Génie des procédés appliqués aux aliments et bioproduits_2024-25 APT_2002_2AD2__UC2_GENIE_DES_PROCEDES_2024_25 Ce cours présente les principes de base du génie des procédés appliqué aux aliments et bioproduits. Quelques concepts génériques seront présentés et détaillés lors de trois cours théoriques introductifs (4,5 h au total) dont les bilans de matière et d'énergie et les nombres adimensionnels facilitant la généralisation des phénomènes d'une échelle à une autre, d'un produit à un autre, d'une condition opératoire à une autre. Ces notions théoriques seront ensuite mobilisées lors de huit séances de TD de 3 h pour permettre aux étudiants de mettre en pratique ces notions et de traiter de manière pratique des problèmes de dimensionnement ou d'optimisation de conditions opératoires de procédés. On insistera à ce niveau sur les hypothèses simplificatrices émises lors de la formalisation des phénomènes et l'homogénéité dimensionnelle des relations obtenues. Des opérations essentiellement thermiques seront abordées dans cet enseignement : chauffage d'un fluide avec ou sans réaction chimique en écoulement dans un réacteur tubulaire ou agité, chauffage de solides avec ou sans changement d'état… Ces séances de TD permettront ainsi de questionner les hypothèses émises lors de la présentation des outils en cours théoriques. Voir le cours
2AD2- UC3 TRANSFO MICROB-D2 - UC3 Transformations microbiennes au service des bio-industries_2024-25 APT_2003_2AD2__UC3_TRANSFO_MICROB_2024_25 Les transformations microbiennes, reposant sur la mise en oeuvre contrôlée de micro-organismes, sont au coeur de nombreuses entreprises de transformation alimentaire et non alimentaire, conduisant à une large gamme de produits intermédiaires et finis (ingrédients, auxiliaires technologiques, aliments, produits cosmétiques, produits pharmaceutiques, molécules pour la chimie et pour l’agriculture, énergie, eaux dépolluées).La connaissance et la maîtrise de ces transformations microbiennes sont donc incontournables pour les futurs ingénieurs AgroParisTech. De plus, ce secteur industriel est caractérisé par une dynamique forte de recherche et développement et propose de réelles opportunités en termes de débouchés.Ce module d'enseignement apporte ces connaissances et compétences par des cours magistraux, une intervention d'un.e professionnel.le du secteur des transformations microbiennes, des TDs d'applications et des travaux pratiques et leur exploitation. De plus afin d'élargir le panorama, les étudiants réaliseront un exposé par groupe sur un bioproduit sous forme de poster. Voir le cours