Cette UE vise à découvrir et explorer la richesse des banques de données de gènes, de génomes, de fonctions et d'interactions (banques "omiques"). Après avoir pris connaissance du contenu de grandes banques omiques, les étudiants réaliseront des protocoles informatiques pour extraire des informations de ces banques et analyser fonctionnellement des réseaux de régulation ou métaboliques à partir des données extraites. 

Contenu:

Cours: Nous verrons comment l'information du génome est représentée dans les grandes banques de données publiques:  génomes complets (Ensembl, RefSeq), gènes (COGs), fonctions (Gene Ontology), santé (COSMIC, OMIM, Orphanet), ou expression (GEO). Nous présenterons des packages informatiques (R ou Python) permettant d'interroger les banques et d'en analyser le contenu. Nous verrons comment analyser les données d'expression pour inférer des réseaux de régulation.

TD et travail personnel: Nous choisirons un réseau de régulation et nous rechercherons les composants de ce réseau dans les différentes bases à l'aide de requêtes programmées. Nous exploiterons des données d'expression pour inférerer un réseau de régulation qui sera représenté graphiquement et informatiquement. Nous intégrerons toutes ces informations pour réaliser un synthèse finale des informations recueillies que nous confronterons à l'état des connaissances sur le réseau étudié. 

Telecom Paris est un centre de formation qui s’appuie sur un laboratoire de recherche reconnu internationalement et dont les publications participent de façon active à l’accroissement des connaissances dans les domaines techniques, économiques et sociologiques. Sur la base de sa recherche, l’école a souhaité ajouter à son offre pédagogique pour les élèves-ingénieurs une formation par la recherche formée de deux UE complémentaires :

• RECH201 : état de l’art
• RECH202 : recherche exploratoire

Le parcours Recherche s’adresse à tous les étudiants intéressés par l’acquisition de compétences à travers la conduite d’un projet de recherche et d’innovation au cœur des thématiques de l’école. RECH201 constitue la phase initiale de ce parcours Recherche.

L’UE Rech201 : Etat de l’art

L’étudiant arrêtera en amont de l’UE un sujet de recherche avec un enseignant-chercheur chargé de l’encadrer. Sur la base de son sujet, il effectuera avec l’aide de son encadrant une recherche bibliographique qui précisera l’état de l’art atteint sur son sujet ainsi que les verrous techniques qui en limitent les performances.

Pour valider l’UE, l’étudiant devra être capable d’expliquer l’importance de son sujet, son impact potentiel et préciser à quel niveau de maturité technologique il se situe, entre travail fondamental et prototypage. Il devra comprendre, quantifier et expliquer les verrous techniques et fondamentaux limitant les performances accessibles dans le cadre de son sujet de recherche.

Renforcer la confiance en soi et Encourager l’autonomie (S1)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de : 1) vous aidez à renforcer votre confiance et soi vis-à-vis l’utilisation de la langue anglaise et 2) vous aidez à devenir plus autonome dans cette langue qui est largement rependu dans le milieu professionnel en ingénierie tant à l’écrit qu’à l’oral.

Etre opérationel.le en anglais à l’international (S2)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de vous aider à pouvoir utiliser l’anglais avec plus d’aisance en interaction avec d’autres personnes dans un milieu académique et/ou professionnel.

Renforcer la confiance en soi et Encourager l’autonomie (S1)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de : 1) vous aidez à renforcer votre confiance et soi vis-à-vis l’utilisation de la langue anglaise et 2) vous aidez à devenir plus autonome dans cette langue qui est largement rependu dans le milieu professionnel en ingénierie tant à l’écrit qu’à l’oral.

Etre opérationel.le en anglais à l’international (S2)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de vous aider à pouvoir utiliser l’anglais avec plus d’aisance en interaction avec d’autres personnes dans un milieu académique et/ou professionnel.

Renforcer la confiance en soi et Encourager l’autonomie (S1)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de : 1) vous aidez à renforcer votre confiance et soi vis-à-vis l’utilisation de la langue anglaise et 2) vous aidez à devenir plus autonome dans cette langue qui est largement rependu dans le milieu professionnel en ingénierie tant à l’écrit qu’à l’oral.

Etre opérationel.le en anglais à l’international (S2)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de vous aider à pouvoir utiliser l’anglais avec plus d’aisance en interaction avec d’autres personnes dans un milieu académique et/ou professionnel.

Renforcer la confiance en soi et Encourager l’autonomie (S1)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de : 1) vous aidez à renforcer votre confiance et soi vis-à-vis l’utilisation de la langue anglaise et 2) vous aidez à devenir plus autonome dans cette langue qui est largement rependu dans le milieu professionnel en ingénierie tant à l’écrit qu’à l’oral.

Etre opérationel.le en anglais à l’international (S2)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de vous aider à pouvoir utiliser l’anglais avec plus d’aisance en interaction avec d’autres personnes dans un milieu académique et/ou professionnel.

Renforcer la confiance en soi et Encourager l’autonomie (S1)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de : 1) vous aidez à renforcer votre confiance et soi vis-à-vis l’utilisation de la langue anglaise et 2) vous aidez à devenir plus autonome dans cette langue qui est largement rependu dans le milieu professionnel en ingénierie tant à l’écrit qu’à l’oral.

Etre opérationel.le en anglais à l’international (S2)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de vous aider à pouvoir utiliser l’anglais avec plus d’aisance en interaction avec d’autres personnes dans un milieu académique et/ou professionnel.

Renforcer la confiance en soi et Encourager l’autonomie (S1)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de : 1) vous aidez à renforcer votre confiance et soi vis-à-vis l’utilisation de la langue anglaise et 2) vous aidez à devenir plus autonome dans cette langue qui est largement rependu dans le milieu professionnel en ingénierie tant à l’écrit qu’à l’oral.

Etre opérationel.le en anglais à l’international (S2)

• L’ingénieur.e de demain doit maitriser l’anglais pour pouvoir communiquer, intervenir et interagir de manière précise, adaptée et pertinente en contexte international et multiculturel. Cette UE a pour objectif de vous aider à pouvoir utiliser l’anglais avec plus d’aisance en interaction avec d’autres personnes dans un milieu académique et/ou professionnel.