| La recherche d'informations en sciences du vivant_S1 2021-2022 |
APT_20121_S1_2021_2022 |
|
Voir le cours |
| 2A-D4-D4 - Ingénierie et santé : Homme, bioproduits, environnement_2021-22 |
APT_2015_2A_D4_2021_22 |
Ce cours rassemble des informations et documents généraux relatifs au domaine 4 pour l'année 2021-2022. Il vient en complément de cours en ligne spécifiques dédiés à chacune des UC du socle commun de domaine. |
Voir le cours |
| 2A-D4-UC Risques-SCD4 - Risques sanitaires environnementaux et alimentaires_2021-22 |
APT_2016_2A_D4_UC_Risques_2021_22 |
Ce cours rassemble tous les contenus concernant l'UC "Risques sanitaires et environnementaux pour l'Homme" du socle commun de domaine 4 : supports de cours, planning, liens vers les salles virtuelles, documents pour les TD et travaux thématiques, etc.
|
Voir le cours |
| 2A-D4-UC Alimentation-SCD4 - Alimentation, aliments et santé de l'Homme_2021-22 |
APT_2017_2A_D4_UC_Alimentation_2021_22 |
Cette UE propose une introduction pluridisciplinaire et multidimensionnelle à l’alimentation de l’Homme, intégrant ses composantes culturelle, hédonique, technologique et nutritionnelle. Le contexte est essentiellement celui de l’alimentation occidentale contemporaine et l’UE s’articule autour de 3 grandes questions : - Comment et quand se construit et s’analyse la qualité nutritionnelle d’un aliment ? - Quels sont les déterminants des choix alimentaires ? - Comment s’analyse l’impact de la qualité nutritionnelle et des choix alimentaire sur la santé du consommateur et des populations ? |
Voir le cours |
| 2A-D4-UC Biol Struct-SCD4 - Biologie structurale et santé_2021-22 |
APT_2020_2A_D4_UC_Biol_Struct_2021_22 |
L’objectif de cette unité d’enseignement est de montrer l’importance des données structurales (de l’échelle atomique à l’échelle cellulaire) pour comprendre et modifier les fonctions biologiques. Pour cela, elle présente quelques exemples en biologie-santé à travers des cours, conférences et travaux dirigés. Elle fait le lien avec des applications biotechnologiques. |
Voir le cours |
| Ath-AGROPT12-AGROPT12 - Imagerie spatiale et surveillance géographique de l'environnement_2021-22 |
APT_2029_Ath_AGROPT12_2021_22 |
- L'imagerie spatiale : historique, acquisitions, état de l'art. Acteurs de l'imagerie spatiale aux échelons local, national et international. Bases physiques et comportement spectral des objets. La couleur, la vision, les émulsions. - Surveillance géographique de l'environnement : l'imagerie spatiale dans les systèmes d'information à référence spatiale et sa répétitivité temporelle. Concepts et méthodes d'analyse spatiale. Mise en oeuvre des zonages. Validité des zonages, qualité des données et prise de décision. Les exemples donnés seront variés, et en particulier relatifs à la gestion des ressources naturelles et agricoles : on peut citer, notamment, le suivi du réchauffement climatique sur les régions de glaciers, la mise en évidence de l'assèchement de la mer d'Aral depuis 1972, la surveillance des inondations, ou la cartographie des risques d'incendies de forêts. - Géotraçabilité. Définitions, enjeux et exemples. - Traitement numérique des images, classifications, interprétations. |
Voir le cours |
| Ath-AGROPT23-AGROPT23 - Nutrition en Conditions Extrêmes_2021-22 |
APT_2037_Ath_AGROPT23_2021_22 |
Les thèmes suivants seront abordés : ? Dynamique digestive et mise à disposition des nutriments (monogastriques, polygastriques) ? Nutrition et efforts (chiens de traîneau, sportifs de haut niveau, treck....) ? Epargne et déposition musculaire : statégies alimentaires. Adaptation à une production intense (production laitière) ? Adaptation à la sous alimentation (sous alimentation dans les zones desertiques, jeûnes, ...). Alimentation en autonomie (raids longue durée, vol spatial, ....) |
Voir le cours |
| Dendrométrie, croissance et production des peuplements forestiers_UC1 |
APT_20599_UC1 |
|
Voir le cours |
| UC1-05-Biologie intégrative, introduction à la complexité du vivant_2021-22 |
APT_2066_UC1_05_2021_22 |
Contenu de l'enseignement 1- Introduction module et bases de l'intégration en biologie + distribution articles (cours), 2- Génomique appliquée à la sélection animale (cours), 3- Intégration en ecophysiologie (cours), 4- Approche de mesure des flux métaboliques chez l'homme (cours & TD), 5- Intégration et modélisation réseau métabolique des microorganismes (TD), 6- Acquisition image confocale (démonstration) et analyse d'image (TD), 7- TD : De l'image au modèle statistique - exemple de reconstruction 3D d'une cellule et de ses compartiments, 8- TD : Intégration transcriptome et protéome chez la plante, 9- Approches intégrées en biotechnologie végétale (cours) |
Voir le cours |
| UC2-25-L'atmosphère : milieu d'échanges, de transports et de régulations_2021-22 |
APT_2070_UC2_25_2021_22 |
L'enseignement est fondé sur les connaissances déjà acquises en 1A. Il approfondit les connaissances des étudiants sur la turbulence, sur les échanges végétation-atmosphère et leur régulation ainsi que sur les couplages existants entre biologie et physique de l'environnement. On introduira également les étudiants à la résolution numérique des problèmes d'écoulement et de transfert. Si le mini-projet , fil conducteur de la pédagogie du module reste essentiellement concentré sur des problématiques à l'échelle locale, la circulation atmosphérique générale et les problèmes soulevés par l'effet de serre additionnel seront le cadre de conférences réalisées par des spécialistes de ces questions actuelles. Elles illustreront les mécanismes physiques décrits en cours à une échelle plus globale. |
Voir le cours |
| UC1-03-A scientific approach to animal welfare_2021-22 |
APT_2071_UC1_03_2021_22 |
Une partie majeure de ce module sera présentée en anglais. Si vous avez des doutes sur votre niveau d'anglais, contactez Hans ERHARD pour en discuter. La société se sent concernée non seulement par la qualité des produits mais de plus en plus par les procédés de production et plus particulièrement le bien-être de l'animal d'élevage. Les conditions de vie des animaux d'élevage sont régulièrement remises en cause.Après une présentation générale sur le bien être animal (origine, définitions), les bases comportementales et physiologiques du bien-être seront précisées (mesures du bien-être, stress, douleur, émotion). Le statut de l'animal sera évoqué sous ses aspects sociologiques et philosophiques. Les rôles et points de vue des différents acteurs (éleveur, chercheur, économiste, consommateur, législateur, protectionniste…) seront étudiés principalement au travers des visites d'élevages et au travers des conférences. |
Voir le cours |
| UC1-09-Dendrométrie, croissance et production des peuplements forestiers_2021-22 |
APT_2073_UC1_09_2021_22 |
L’UC vise à fournir les bases nécessaires aux métiers de la gestion forestière en termes de biométrie forestière (caractérisation quantitative de l'arbre, du peuplement, et du massif forestier) et de caractérisation des peuplements forestiers et de leur dynamique (concepts, méthodes, modèles).Caractérisation dendrométrique de l'arbre : diamètre, hauteur, forme et volume. Définitions des grandeurs, appareils et méthodes de mesure, analyse et précision des mesures, estimation indirecte par tarif de cubage. Caractérisation dendrométrique des peuplements : densité, surface terrière, volume, hauteur dominante. Analyse de données d'inventaire forestier et calcul de la précision des estimations.Développement de l'arbre. Description des processus dynamiques et des différentes mesures de productivité à l'échelle de l'arbre et du peuplement. Présentation des différentes approches de modélisation de la croissance forestière. |
Voir le cours |
| UC1-04-Bioingénierie des protéines et applications industrielles_2021-22 |
APT_2075_UC1_04_2021_22 |
Le programme comporte des cours, des conférences, des TP et TD sur les méthodes d'etudes structurales des protéines et sur diverses applications, illustrés par une visite d'entreprise (selon les disponibilités).- COURS ET CONFERENCES - Méthodes d'étude des structures tridimensionnelles des protéines (radiocristallographie, résonance magnétique nucléaire, cryomicroscopie électronique, biophysique des protéines membranaires, spectrométrie de masse). Relations structure-activité - Exemples d'applications industrielles: enzymes (agroalimentaire, détergents, textile), inhibiteurs de sialidases contre la grippe, laccases fongiques et dépollution. - Développement d'une start-up biotechnologique, dépôt de brevets. - TRAVAUX PRATIQUES ET TRAVAUX DIRIGES - Initiation à la cristallographie des protéines (lysozyme). - VISITE, par exemple : - Centre de Recherches Sanofi-Aventis, Département de biologie structurale, Vitry-sur-Seine - Grands instruments et biologie structurale : visite du synchrotron Soleil, Saclay. |
Voir le cours |
| UC5-27-Communication Nutrition-Santé sur les produits alimentaires_2021-22 |
APT_2077_UC5_27_2021_22 |
La qualité nutritionnelle et de santé des aliments commercialisés fait l'objet d'une forte attention par le consommateur. De nombreux produits (aliments courants ou compléments alimentaires) suggèrent ou revendiquent un intérêt nutritionnel et/ou un bénéfice pour la santé du consommateur et cette communication est au cœur d'enjeux importants. Les enjeux de la communication nutrition-santé se trouvent au croisement de la science nutritionnelle, en essor, des règles du Droit, en mutation, et des velléités de positionnement et d'innovation du secteur marchant. Cette UC aborde donc ce sujet de façon interdisciplinaire, et par des approches par l'objet. [Voir objectifs pédagogiques] |
Voir le cours |
| UC1-12-Food safety and risk analysis through the food chain_2021-22 |
APT_2078_UC1_12_2021_22 |
Since the '90s awareness about food safety among consumers has increased, while the standards and progress in conservation and traceability could suggest the disappearance of this type of problem. The word "chemical hazard" sounds still bad, as shown by the recent case "Fipronil eggs contamination" and mass media often contribute to an exaggerated perception of the real hazards. In this context, it seems necessary to provide a better knowledge of the relationship between modes of production and processing of agricultural commodities and food safety for humans. How can we objectively assess the impact of exogenous, endogenous and newly formed contaminants? How regulation (at French, European and global levels) allows it to protect consumers' health while providing a modern industrial production and fair trade rules? The aim of this module is to give the principles of risk analysis steps (assessment, management, communication) throughout the whole food chain in order to provide valuable tools to control and solve critical cases. An engineer familiar with the principles of assessment and control of chemical risks possesses precious tools for managing and controlling critical cases. Within this course, we will mobilize study cases illustrating similarities and differences existing between food industries regarding risk management. |
Voir le cours |
| UC2-16-Méthodes et modèles d'aide à la décision dans l'entreprise_2021-22 |
APT_2087_UC2_16_2021_22 |
L'enseignement comporte : - Des apports méthodologiques et d'approfondissement, des travaux dirigés et des travaux pratiques présentant les principales méthodes d'aide à la décision et répondant à des questions concrètes. Les thèmes suivants seront abordés : - Planification de projets - Programmation linéaire, programmation linéaire en nombres entiers, programmation par contraintes - Investissement séquentiel - Problèmes d'affectation de ressources - Théorie de la décision - Le problème du voyageur de commerce - Gestion des files d'attente |
Voir le cours |
| UC2-06-Behaviour and Neurobiology_2021-22 |
APT_2088_UC2_06_2021_22 |
|
Voir le cours |
| UC2-04-Bioéthique et Biovigilance_2021-22 |
APT_2092_UC2_04_2021_22 |
Principes philosophiques. Lois de bioéthique. Droits de l'homme. Droit des malades. L'éthique dans l'exploration spatiale - Le don d'organes - La médecine prédictive - La recherche biomédicale et éthique de la recherche sur l'homme - La recherche sur les gènes, cellules, organes - Les cellules souches - Les neurosciences. |
Voir le cours |
| UC2-05-Biotechnologies animales_2021-22 |
APT_2093_UC2_05_2021_22 |
· Biotechnologies du génome : génomique structurale et fonctionnelle, transcriptomique, protéomique - présentation, applications et limites de ces approches à haut débit. · Biotechnologies de la reproduction : transplantation embryonnaire, fécondation in vitro, sexage, clonage, transgenèse animale. · Biotechnologies des aliments et de la nutrition, conséquences pour la qualité des produits animaux et la sécurité du consommateur. Etat des lieux et marché actuel de ces biotechnologies. · Bioéthique, brevetabilité du vivant, acceptation sociale |
Voir le cours |
| UC2-08-Écologie végétale : biodiversité et dynamique des communautés_2021-22 |
APT_2094_UC2_08_2021_22 |
L'objectif de ce module est de fournir des éléments permettant la connaissance effective de la diversité végétale vasculaire et son évolution spatio-temporelle et ceci dans un contexte scientifique et socio-politique. |
Voir le cours |
| UC2-15-Mécanismes et évolution de la pathogénie : interactions cellulaires_2021-22 |
APT_2097_UC2_15_2021_22 |
Introduction à la biologie et à l'écologie des pathogènes : bactéries, virus, champignons et autres parasites. Défenses immunes de l'homme et des plantes vis-à-vis des agents infectieux. Mécanismes de la pathogénie, détournement des fonctions cellulaires et en particulier du système immunitaire. Ecologie des interactions microbe-animaux, microbes-plantes. Techniques d'étude des mécanismes de pathogénie des microbes. Génétique et évolution de la pathogénie, transferts de l'information génétique, évolution des structures. Coût social des maladies infectieuses, moyens de lutte. |
Voir le cours |
| UC2-17-Méthodes et outils d'analyse spatiale et de diagnostic sylvicole_2021-22 |
APT_2098_UC2_17_2021_22 |
SIG : cours et TD permettant une utilisation de base des systèmes d'information géographique et des GPS (acquisition et navigation).Application de ces connaissances (et de celles déjà abordées dans d'autres UC du SCD1-forêt en sylviculture et dendrométrie) au cours d'un mini-projet de diagnostic de stations et peuplements forestiers à l'échelle d'un groupe de parcelles. |
Voir le cours |
| UC3-01-Initiation à la biologie de synthèse_2021-22 |
APT_2119_UC3_01_2021_22 |
Génomique et post-génomique. Rappel sur les méthodologies de séquençage et d'analyse des génomes. Approches globales du fonctionnement des génomes : transcriptome, protéome, métabolome, interactome, … Introduction à la biologie des systèmes. Flux métaboliques et MCA. Différents types de modélisation (métabolique vs cinétique) Approches « top down » vs. « bottom up ». Biologie de synthèse et biotechnologie. Illustration des différentes approches par des travaux pratiques en biologie de synthèse et des visites de laboratoires à l'INRA de Jouy-en-Josas. Située en aval de l'UC Biologie Intégrative, cette UC a été pensée pour être complémentaire en apportant un volet appliqué via des aspects d'ingénierie métabolique et de biologie de synthèse. |
Voir le cours |
| UC3-02-Biodiversité et Evolution_2021-22 |
APT_2120_UC3_02_2021_22 |
Histoire des idées sur l'évolution, La génétique écologique, L'apport des molécules, Sélection et neutralité, Le gène égoïste, Le finalisme revisité, L'évolution du génome, Conflits et niveaux de sélection, Les contraintes dans l'évolution, La théorie des jeux appliquée à l'évolution, L'évolution du sexe, La sénescence et la mort, La sociobiologie, L'origine de la vie et la biologie synthétique.L'UC alterne les conférences par les enseignants ou des intervenants extérieurs avec des moments de débat d'idées et d'échanges collectifs. |
Voir le cours |
| UC5-26-Milieux humides : écologie fonctionnelle, réglementation et gestion_2021-22 |
APT_2121_UC5_26_2021_22 |
Selon le type de milieux humides, les aspects suivants pourront être abordés : définition et spécificités; fonctionnement hydrologique et/ou géochimique et/ou pédologique; fonctionnement biologique et biodiversité, habitats naturels; fonctions environnementales et sociétales. |
Voir le cours |
| UC3-07-UC3 Applied ethology_2021-22 |
APT_2123_UC3_07_2021_22 |
D'une question scientifique à un article scientifique : l'approche scientifique de la science.Des cours sur l'éthologie appliquée, les méthodes éthologiques, l'analyse des données comportementales et la rédaction d'un article scientifique donneront les bases pour l'application sur le terrain. Vous allez concevoir une étude comportementale, tester vos méthodes, effectuer une étude comportementale, analyser les données et rédiger un article scientifique sur votre étude. Warning! Sufficient skills in English and French required to be able to follow a lecture and to read scientific articles. If you are worried about your level of English (or French), please contact Hans ERHARD. |
Voir le cours |
| UC3-18-Milieux intertropicaux : fonctionnement, mise en valeur, préservation_2021-22 |
APT_2131_UC3_18_2021_22 |
L'UC est organisée en deux temps d'égale importance : i) un apport des connaissances de base au travers de cours et de conférence et ii) l'approfondissement et la mobilisation de ces connaissances par des travaux personnels autour d'une étude de cas. Dans un premier temps, les cours et conférences ont pour objectif de fournir les éléments clés de connaissance concernant :les principales spécificités du milieu biotique et abiotique en contexte intertropical (climats, sols, forêts)les grands types de mise en valeur par l'agriculture qu'il s'agisse des systèmes de culture traditionnels, conventionnels ou innovants.les facteurs et enjeux socio-économiques globaux et locaux qui sous-tendent les différents systèmes de culture.les possibilités et les méthodes d'évaluation et de développement des performances économiques et environnementales de ces différents systèmes de culture.Dans un second temps, les études de cas réalisées en petits groupes ont pour objectif de compléter les cours et conférences en approfondissant l'étude d'un dossier dont le sujet est laissé libre (après validation par l'équipe pédagogique). Le sujet de l'étude de cas peut concerner une production végétale tropicale, la gestion d'un système de culture tropical ou un problème de conservation des milieux tropicaux avec entre autres exemples :Les systèmes de culture à bas niveau d'intrant en Afrique de l'Ouest,La lutte contre l'érosion au Burkina Faso,La culture du palmier à huile,La durabilité des systèmes de culture à base de bananier plantain au Cameroun.Les Investissements agricoles étrangers en Afrique : évolutions, état des lieux et perspectives de développement pour les populations locales. |
Voir le cours |
| UC4-08-Environnements et politiques_2021-22 |
APT_2143_UC4_08_2021_22 |
- Histoire et évolution des mouvements sociaux environnementaux - comportements politiques- Elections, opinion et enjeux environnementaux- Théories de l'environnement |
Voir le cours |
| UC4-09-Fermentation-distillation: des boissons aux biocarburants_2021-22 |
APT_2144_UC4_09_2021_22 |
La fermentation alcoolique d'un substrat sucré, obtenu à partir de fruits, de betterave, de canne ou après hydrolyse de l'amidon de blé ou de maïs, repose sur la mise en oeuvre de la levure Saccharomyces cerevisiae. L'optimisation de la fermentation implique de maîtriser le fonctionnement biologique et physiologique du micro-organisme, de définir les conditions de production telles que la température, le pH, la concentration en sucre, et de concevoir et conduire des installations industrielles de fermentation permettant d'atteindre les objectifs de rentabilité fixés. A l'issue de la fermentation, la solution alcoolique obtenue, appelée vin, subit différents traitements en fonction du produit final que l'on cherche à obtenir, notamment la séparation des levures. Dans le domaine des eaux-de-vie, la distillation est conduite soit en discontinu de manière simple soit en continu multi-étagée pour récupérer l'éthanol et les composés d'arôme. Quand une concentration élevée en éthanol est recherchée (cas de certaines eaux-de-vie, de l'alcool surfin et de l'alcool carburant), la séparation est réalisée en continu dans une ou plusieurs colonnes à distiller multi-étagées. Pour l'obtention d'alcool déshydraté (alcool absolu ou alcool carburant) une étape supplémentaire de déshydratation est nécessaire. L'ensemble de ces étapes nécessite une bonne compréhension des paramètres de distillation et du comportement des composés volatils d'arômes autres que l'éthanol présents dans les vins. Cette UC prend également en compte les conséquences environnementales de cette production qui sont au coeur des préoccupations des industriels de la filière en orientant leurs choix technologiques, avec notamment la production de co-produits valorisables. |
Voir le cours |
| UC4-18-Reboisement, génétique et amélioration_2021-22 |
APT_2151_UC4_18_2021_22 |
Sujets traités : Génétique des populations d'arbres, adaptation au milieu et notion de "provenances". Amélioration génétique, sélection. Conservation des ressources et de la diversité génétique. Récolte des graines, classement des peuplements de reproduction. Culture des plants en pépinière. Techniques de plantation, préparation des sols, entretiens de plantations. Choix en fonction des stations, des sols , du niveau d'investissement consenti. Cas spécifiques des reboisements par placeaux en forêt. Application à l'élaboration d'un cahier des charges. |
Voir le cours |
