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2024_Outils Biotechnologiques - Analyse de données multi-omiques
Séance 4 (Fabrice) - 05/03/2025
Supplementary data
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Table S7-S14
Completion requirements
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Annonces
Planning des séances
Présentation de l'UE
Feuille de plan de séance (1)
Article scientifique - Ddr0
Présentation de la plateforme Bioinformatique Galaxy
Cours Fabrice (présentation du système DdrO)
Pipeline d'analyse de données RNAseq
TP1 - Galaxy
TP2 - Galaxy
Feuille de plan de séance (2)
Correction Quiz (1)
TP3 - Galaxy
Grands principes de l'analyse différentielle
TP4 - Galaxy
La méthode DESeq2
TP5 - Galaxy
Feuille de plan de séance (3)
Correction Quiz (2)
Fichier de résultats - DESeq2 (TP4)
Points de vigilance en statistiques
Exemples de visualisation IGV
Feuille de plan de séance (4)
Correction Quiz (3)
resultats_RNAseq_2025.xlsx
Analyse du gène ddrO-2025
Boite de dépot gène ddrO
Supplementary Data
Table S3
Table S4
Table S5
Feuille de plan de séance (5)
Analyse de données ChIPseq
Liste des pics de l'article (logiciel bPeaks)
Séquences des pics de l'article (logiciel bPeaks)
(Bonus) Extraction des séquences des pics (script R)
Consignes pour la rédaction du rapport
fichier Fasta de l'snemble des séquences promotrices
2025-03-19_plan_séance-6
TP6: recherche d emotifs de fixation
Compte rendu d'analyses de données
Feuille de plan de séance (5) ►
eCampus
Université Paris-Saclay
7
Institut Polytechnique de Paris
3
European University Alliance for Global Health (EUGLOH)
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