Outils Biotechnologiques - Analyse de données multi-omiques

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  • Sélectionner l’activité Annonces

    

    Annonces Forum

• Informations générales
  • Sélectionner l’activité Planning des séances

    

    Planning des séances URL
  • Sélectionner l’activité Présentation de l'UE

    

    Présentation de l'UE Fichier PDF

• Séance 1 - 05/02/2025
  • Sélectionner l’activité Feuille de plan de séance (1)

    

    Feuille de plan de séance (1) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Article scientifique - Ddr0

    

    Article scientifique - Ddr0 Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Présentation de la plateforme Bioinformatique Galaxy

    

    Présentation de la plateforme Bioinformatique Galaxy URL
  • Sélectionner l’activité Cours Fabrice (présentation du système DdrO)

    

    Cours Fabrice (présentation du système DdrO) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Pipeline d'analyse de données RNAseq

    

    Pipeline d'analyse de données RNAseq Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité TP1 - Galaxy

    

    TP1 - Galaxy Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité TP2 - Galaxy

    

    TP2 - Galaxy Fichier PDF

• Séance 2 - 12/02/2025
  • Sélectionner l’activité Feuille de plan de séance (2)

    

    Feuille de plan de séance (2) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Correction Quiz (1)

    

    Correction Quiz (1) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité TP3 - Galaxy

    

    TP3 - Galaxy Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Grands principes de l'analyse différentielle

    

    Grands principes de l'analyse différentielle Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité TP4 - Galaxy

    

    TP4 - Galaxy Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité La méthode DESeq2

    

    La méthode DESeq2 Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité TP5 - Galaxy

    

    TP5 - Galaxy Fichier PDF

• Séance 3 - 19/02/2025
  • Sélectionner l’activité Feuille de plan de séance (3)

    

    Feuille de plan de séance (3) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Correction Quiz (2)

    

    Correction Quiz (2) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Fichier de résultats - DESeq2 (TP4)

    

    Fichier de résultats - DESeq2 (TP4) XLSX
  • Sélectionner l’activité Points de vigilance en statistiques

    

    Points de vigilance en statistiques Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Exemples de visualisation IGV

    

    Exemples de visualisation IGV Fichier PNG

• Séance 4 (Fabrice) - 05/03/2025
  • Sélectionner l’activité Feuille de plan de séance (4)

    

    Feuille de plan de séance (4) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Correction Quiz (3)

    

    Correction Quiz (3) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité resultats_RNAseq_2025.xlsx

    

    resultats_RNAseq_2025.xlsx Fichier XLSX
  • Sélectionner l’activité Analyse du gène ddrO-2025

    

    Analyse du gène ddrO-2025 Fichier DOCX
  • Sélectionner l’activité Boite de dépot gène ddrO

    

    Boite de dépot gène ddrO Devoir

    Ouvert le : mardi 11 mars 2025, 00:00

    À rendre : mercredi 12 mars 2025, 23:59

  • Supplementary data
    • Sélectionner l’activité Supplementary Data

      

      Supplementary Data Fichier PDF
    • Sélectionner l’activité Table S3

      

      Table S3 Fichier XLSX
    • Sélectionner l’activité Table S4

      

      Table S4 Fichier XLSX
    • Sélectionner l’activité Table S5

      

      Table S5 Fichier XLSX
    • Sélectionner l’activité Table S7-S14

      

      Table S7-S14 Fichier XLSX

• Séance 5 - 12/03/2025
  • Sélectionner l’activité Feuille de plan de séance (5)

    

    Feuille de plan de séance (5) Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Analyse de données ChIPseq

    

    Analyse de données ChIPseq Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité Liste des pics de l'article (logiciel bPeaks)

    

    Liste des pics de l'article (logiciel bPeaks) Fichier BED
  • Sélectionner l’activité Séquences des pics de l'article (logiciel bPeaks)

    

    Séquences des pics de l'article (logiciel bPeaks) Fichier FASTA
  • Sélectionner l’activité (Bonus) Extraction des séquences des pics (script R)

    

    (Bonus) Extraction des séquences des pics (script R) Fichier R
  • Sélectionner l’activité Consignes pour la rédaction du rapport

    

    Consignes pour la rédaction du rapport Fichier PDF

• Séance 6 (Fabrice)- 19/03/2025
  • Sélectionner l’activité fichier Fasta de l'snemble des séquences promotrices

    

    fichier Fasta de l'snemble des séquences promotrices FASTA
  • Sélectionner l’activité 2025-03-19_plan_séance-6

    

    2025-03-19_plan_séance-6 Fichier PDF
  • Sélectionner l’activité TP6: recherche d emotifs de fixation

    

    TP6: recherche d emotifs de fixation Fichier PDF

• Rendu du compte rendu d'analyses
  • Sélectionner l’activité Compte rendu d'analyses de données

    

    Compte rendu d'analyses de données Devoir

    Ouvert le : mardi 1 avril 2025, 00:00

    À rendre : mercredi 2 avril 2025, 14:00