Outils Biotechnologiques - Analyse de données multi-omiques

Topic outline

• Collapse all Expand all
  • Select activity Annonces

    

    Annonces Forum

• Informations générales
  • Select activity Planning des séances

    

    Planning des séances URL
  • Select activity Présentation de l'UE

    

    Présentation de l'UE File PDF

• Séance 1 - 05/02/2025
  • Select activity Feuille de plan de séance (1)

    

    Feuille de plan de séance (1) File PDF
  • Select activity Article scientifique - Ddr0

    

    Article scientifique - Ddr0 File PDF
  • Select activity Présentation de la plateforme Bioinformatique Galaxy

    

    Présentation de la plateforme Bioinformatique Galaxy URL
  • Select activity Cours Fabrice (présentation du système DdrO)

    

    Cours Fabrice (présentation du système DdrO) File PDF
  • Select activity Pipeline d'analyse de données RNAseq

    

    Pipeline d'analyse de données RNAseq File PDF
  • Select activity TP1 - Galaxy

    

    TP1 - Galaxy File PDF
  • Select activity TP2 - Galaxy

    

    TP2 - Galaxy File PDF

• Séance 2 - 12/02/2025
  • Select activity Feuille de plan de séance (2)

    

    Feuille de plan de séance (2) File PDF
  • Select activity Correction Quiz (1)

    

    Correction Quiz (1) File PDF
  • Select activity TP3 - Galaxy

    

    TP3 - Galaxy File PDF
  • Select activity Grands principes de l'analyse différentielle

    

    Grands principes de l'analyse différentielle File PDF
  • Select activity TP4 - Galaxy

    

    TP4 - Galaxy File PDF
  • Select activity La méthode DESeq2

    

    La méthode DESeq2 File PDF
  • Select activity TP5 - Galaxy

    

    TP5 - Galaxy File PDF

• Séance 3 - 19/02/2025
  • Select activity Feuille de plan de séance (3)

    

    Feuille de plan de séance (3) File PDF
  • Select activity Correction Quiz (2)

    

    Correction Quiz (2) File PDF
  • Select activity Fichier de résultats - DESeq2 (TP4)

    

    Fichier de résultats - DESeq2 (TP4) File XLSX
  • Select activity Points de vigilance en statistiques

    

    Points de vigilance en statistiques File PDF
  • Select activity Exemples de visualisation IGV

    

    Exemples de visualisation IGV File PNG

• Séance 4 (Fabrice) - 05/03/2025
  • Select activity Feuille de plan de séance (4)

    

    Feuille de plan de séance (4) File PDF
  • Select activity Correction Quiz (3)

    

    Correction Quiz (3) File PDF
  • Select activity resultats_RNAseq_2025.xlsx

    

    resultats_RNAseq_2025.xlsx File XLSX
  • Select activity Analyse du gène ddrO-2025

    

    Analyse du gène ddrO-2025 File DOCX
  • Select activity Boite de dépot gène ddrO

    

    Boite de dépot gène ddrO Assignment

    Opened: Tuesday, 11 March 2025, 12:00 AM

    Due: Wednesday, 12 March 2025, 11:59 PM

  • Supplementary data
    • Select activity Supplementary Data

      

      Supplementary Data File PDF
    • Select activity Table S3

      

      Table S3 File XLSX
    • Select activity Table S4

      

      Table S4 File XLSX
    • Select activity Table S5

      

      Table S5 File XLSX
    • Select activity Table S7-S14

      

      Table S7-S14 File XLSX

• Séance 5 - 12/03/2025
  • Select activity Feuille de plan de séance (5)

    

    Feuille de plan de séance (5) File PDF
  • Select activity Analyse de données ChIPseq

    

    Analyse de données ChIPseq File PDF
  • Select activity Liste des pics de l'article (logiciel bPeaks)

    

    Liste des pics de l'article (logiciel bPeaks) File BED
  • Select activity Séquences des pics de l'article (logiciel bPeaks)

    

    Séquences des pics de l'article (logiciel bPeaks) File FASTA
  • Select activity (Bonus) Extraction des séquences des pics (script R)

    

    (Bonus) Extraction des séquences des pics (script R) File R
  • Select activity Consignes pour la rédaction du rapport

    

    Consignes pour la rédaction du rapport File PDF

• Séance 6 (Fabrice)- 19/03/2025
  • Select activity fichier Fasta de l'snemble des séquences promotrices

    

    fichier Fasta de l'snemble des séquences promotrices File FASTA
  • Select activity 2025-03-19_plan_séance-6

    

    2025-03-19_plan_séance-6 File PDF
  • Select activity TP6: recherche d emotifs de fixation

    

    TP6: recherche d emotifs de fixation File PDF

• Rendu du compte rendu d'analyses
  • Select activity Compte rendu d'analyses de données

    

    Compte rendu d'analyses de données Assignment

    Opened: Tuesday, 1 April 2025, 12:00 AM

    Due: Wednesday, 2 April 2025, 2:00 PM