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Nom complet Nom abrégé Résumé
EN2108-Réactions indésirables aux aliments_2025-26 APT_8116_EN2108_2025_26 Objectifs:A l’issue de ce module, les étudiants seront en mesure :- de décrire les mécanismes physiologiques en relation avec la notion de barrière digestive ; - d’expliquer quels sont les risques de réactions indésirables associés à l’alimentation et de les illustrer;- d’expliciter les moyens de détection et de prévention pour éviter les réactions indésirables.Contenu:Composés indésirables dans l’alimentation ; Barrière digestive ; Risque microbiologique dans l’eau et les aliments ; Méthodes d’évaluation de la toxicité des aliments ; Allergies ; Prédiction de l’allergénicité ; Alimentation et physiopathologie colique ; Toxines fongiques ; Toxines bactériennes ; Maladie cœliaque Voir le cours
EN2110-Statistiques appliquées à la nutrition_2025-26 APT_8117_EN2110_2025_26 Objectifs :Former les étudiants au traitement  statistique des données issues des études en nutrition, notamment avec les modèles linéaires.Contenu :Régression linéaire, analyse de variance, analyse en mesures répétées, modèle mixte Voir le cours
EN1540-Microbiote intestinal_2025-26 APT_8119_EN1540_2025_26 Objectifs: Acquérir des connaissances récentes sur les mécanismes qui lient les aliments, le microbiote intestinal et la santé de l'hôte. Appréhender des « stratégies » de manipulation du microbiote pour intervenir sur la santé de l'hôte. Dégager l'impact sociétal et les conséquences en termes de santé publique. Contenu:Le microbiote intestinal est de plus en plus souvent pris en compte en santé humaine en tant que facteur bénéfique ou délétère (digestion, fonction et dysfonction immunitaires, obésité, comportement alimentaire, infections, etc).Le contenu développé dans cette UE permet, dans un premier temps, de définir et de décrire l'écosystème digestif. Les fonctions physiologiques de cet écosystème sont ensuite détaillées en signalant particulièrement l’impact du compartiment microbien. Une part importante de cette UE est consacrée à l’étude des interactions entre le microbiote intestinal et l'hôte, en particulier, leurs rôles et/ou leurs conséquences sur la nutrition de l’Homme, sa physiologie et sa santé.Cette UE comprend des cours et des conférences dispensées par des chercheurs, des acteurs dans le domaine de la santé. Une très large part est faite à un projet expérimental qui permet de mettre en évidence (chez le rat) les conséquences de la manipulation du régime alimentaire sur la composition et les activités du microbiote intestinal et sur la santé de l’hôte. Voir le cours
EN2145-Froid et maîtrise de la qualité_2025-26 APT_8132_EN2145_2025_26 Le froid est communément mis en œuvre pour la stabilisation et/ou la transformation des produits alimentaires, mais il assure aussi la conservation de fonctions vitales (activités biologiques des cellules et des tissus). L'objectif du module est de former les élèves aux principaux concepts qui président à l'application du froid artificiel. Au cours du module, différentes questions seront abordées :Quels problèmes technologiques et environnementaux pose la production de froid ?Comment maîtriser les échanges avec les produits à réfrigérer ou à congeler ?Que se passe-t-il dans les cellules et/ou tissus lors de la transformation de l'eau en glace?Quels sont les procédés frigorifiques à mettre en œuvre pour une production industrielle alimentaire ou biologique ?Contenu: L'enseignement comporte des cours et des conférences, des travaux dirigés, des travaux pratiques et la réalisation d'un mini-projet par petit groupe. Ce module sera complété par la visite d'un site industriel utilisant le froid.  Voir le cours
EN2146-Génie de la réaction chimique dans les matrices alimentaires_2025-26 APT_8133_EN2146_2025_26 Les enjeux du « génie de la réaction dans les matrices alimentaires » sont de :Mesurer et comprendre les réactions (chimiques, enzymatiques) et leurs dynamiques dans des milieux modèles et au sein des produits alimentaires. Il s'agit d'acquérir des données (cinétiques) dans les conditions de transformation, de conservation et d'usage domestique des aliments.Développer des modèles pour prédire la réactivité des constituants, conduire les procédés et maîtriser les propriétés des aliments.  Voir le cours
EN2175-Epistémologie, Histoire des Sciences_2025-26 APT_8155_EN2175_2025_26 Description du contenu de l'enseignementObjectifs: L'histoire et la philosophie des sciences sont un complément nécessaire à la formation de l'esprit scientifique.L'objectif de cet enseignement est de proposer une introduction à ces domaines, par le biais d'études de cas choisis dans les sciences du vivant.Il s'agit de développer une réflexion critique et autonome sur les méthodes et les objets de la science en général et de la biologie en particulier.Contenu: Sont abordées les questions suivantes :-    Le concept de méthode scientifique à travers les âges.-    Créer de la vie : defi technique ou défi théorique ?-    Qu'y a-t-il derrière un concept : histoire de la notion de programme génétique.-    Histoire des réceptions critiques du darwinisme.-    Doute nécessaire, doute instrumentalisé : le scientifique face à l'inconnu.-    Qu'est-ce qu'une imposture scientifique ?-    Science et société : nouvelles formes d'expertise, panels citoyens, débats public.-    Regards de philosophe sur l'Animal.Conférences par des enseignants d'AgroParisTech ou invités- Etudes de textes et documents audiovisuels – Débats – Présentations Orales. Voir le cours
EN2176-Microbiologie, génétique et physiologie cellulaire_2025-26 APT_8156_EN2176_2025_26 Objectifs:Former les étudiants aux bases scientifiques et techniques dans le domaine de la microbiologie, de la génétique, de la biologie cellulaire, métabolisme, physiologie et nutrition.Contenu:Les enseignements sont organisés en deux modules. MGPCell1 et MGPCell 2. Le module de MGPCell1 aborde la Microbiologie, Génétique, Biologie Cellulaire. MGPCell 2 traite des bases de la biologie cellulaire et moléculaire, du métabolisme et du rôle des nutriments dans le contrôle des orientations métaboliques, de la physiologie et de la nutrition.Les enseignements sont organisés en:Ccours magistraux:Biologie Cellulaire,Biologie moléculaire,Microbiologie,Physiologie et voies métaboliques associées,NutritionTravaux pratiques:Microbiologie : Techniques de base de manipulation des micro-organismes, et Identification des bactéries,Génétique microbienne : Clonage, criblage, électrophorèse,Physiologie et nutrition : Influence de l’état nutritionnel l'induction de la lipogenèseTravaux dirigés:biochimie, microbiologie,biologie moléculaire, sociologie de l'alimentation, modélisation, nutrition. Voir le cours
EN2160-Food Process Engineering_2025-26 APT_8190_EN2160_2025_26 Aim: The purpose of this course is to give students an introduction to basic food process engineering principles. Content: The course is based on 13 sessions, each session including a short lecture on theoretical aspects coupled to tutorials on practical problems. The final exam consists of classical problems encountered in food engineering, to resolve in a limited time. Voir le cours
EN2161-Comprehensive food science and analysis_2025-26 APT_8191_EN2161_2025_26 Aim: The purpose with the course is to give students basic knowledge of (i) food science (structure, reactivity and functionality of food components) (ii) strategies for analysing food products (instrumental and sensorial) and (iii) food safety and (iv) food microbiology.Content: The course is based on lectures (22h), tutorial work (30h) and personal work to prepare the tutorial work (15h). It deals with food component reactivity and functionality, microbiological transformations, food analysis (e.g. rheology, sensory analysis), food safety and the role of packaging in food preservation. All these topics will be integrated in a final case study. A visit of Grignon experimental farm will be organised. Voir le cours
EN2165-Junior R&D Project_2025-26 APT_8194_EN2165_2025_26 Aim: The purpose of the course is to put the students into a project management situation working on a practical case issued from an industrial/R&D food design topic. Students gathered in teams will be in charge of analysing, find a strategy, and solve a practical case. Content: This module concerns the different steps and issues of R&D projects. Groups of 5 students will be in charge of a precise mission in order to answer to a specific industrial question on product/process issues (e.g. reformulation issues, eco-conception of product or processes, etc.). Students' work will be divided among literature review, experimental part (if applicable), technical and scientific reporting (oral and written). Voir le cours
EN1982-Agronomy for global issues_2025-26 APT_8448_EN1982_2025_26 Les agronomes, contrairement aux économistes ou aux climatologues, ont commencé à travailler à l'échelle mondiale récemment. En effet, les agronomes ont un rôle à jouer pour relever les défis mondiaux dans le contexte d'une croissance rapide de la population mondiale et de l'évolution des régimes alimentaires, et de la nécessité de réduire l'empreinte écologique de l'agriculture. Afin de présenter le rôle que les agronomes peuvent jouer pour relever ces défis mondiaux, les conférences et les travaux de groupe s'articuleront autour d'une question centrale : "Doubler la production alimentaire à l'horizon 2050 ? Cette question centrale sera abordée sous plusieurs angles, en mettant en évidence les tendances passées et actuelles des principaux éléments et résultats du système alimentaire mondial (production agricole, pertes et déchets alimentaires, sécurité alimentaire) et les méthodes utilisées par les agronomes pour faire face à ces problèmes mondiaux. Voir le cours
EN1993-Régulations biologiques et biologie intégrative_2025-26 APT_8449_EN1993_2025_26 L'objectif du module est de transmettre des savoirs et des savoir-faire sur (i) les mécanismes de régulations biologiques à l'œuvre dans les agroécosystèmes sur les communautés animales et végétales et leur activité (ii) l'impact des systèmes de culture sur ces mécanismes, sur la biodiversité et l'activité biologique (iii) donner des pistes pour l'utilisation des régulations biologiques pour construire des systèmes de culture plus durables. Voir le cours
EN1994-Concevoir des sytèmes à l'échelle du territoire_2025-26 APT_8450_EN1994_2025_26 L'objectif du module est de montrer comment l'agronome identifie, hiérarchise voire modélise les interactions d'ordre agroécologique et socioéconomique entre parcelles agricoles, entre exploitations agricoles, entre acteurs utilisant un même territoire pour concevoir et évaluer des systèmes techniques complexes (système d'approvisionnement d'industriel, bassin versant, habitat d'espèces à protéger …). Ce faisant l'agronome (ou l'agro-écologue) se trouvera fréquemment dans une posture de recherche-action au contact d'acteurs aux intérêts divers vis-à-vis des pratiques à développer dans ces territoires.On montrera comment cette posture justifie des dispositifs interdisciplinaires permettant d'analyser les stratégies et les décisions des acteurs, d'aborder les questions d'aide à la décision privée et publique ou à la négociation entre acteurs. Voir le cours
EN1997-AAE - Projet d'approfondissement pluridisciplinaire_2025-26 APT_8452_EN1997_2025_26   Voir le cours
EN1999-Statistiques_2025-26 APT_8454_EN1999_2025_26 L'objectif de ce module est d'approfondir les connaissances en modélisation statistique tant sur les aspects théoriques que pratiques. On s'intéressera tout particulièrement aux questions soulevées par les applications en agronomie et écologie.  Voir le cours
EN1984-Biosphere-Atmosphere interactions at local scale_2025-26 APT_8460_EN1984_2025_26 Understanding, modelling, measuring the interactions between the biosphere and atmosphere at fine scale (plants, leaf, …scales). Those interactions are key parameters to understand of the biosphere and (agro) ecosystems functioning, and to assesses Curriculum : Plant-Ecosystem-Atmosphere Interactions Mass and Energy transfer between plants soil and atmosphere within the atmospheric boundary layer (energy budget, water transfer, evaporation, CO2 exchange, pollution and GHG emission (a)biotic particles transfer).Outcomes: Aside of knowledge and a good understanding of the fundamentals of biosphere-atmosphere interaction and biophysics mechanisms, the course aims to provide also a good know-how in modelling, monitoring and data processing in such domain. Voir le cours
EN1988-Land-use engineering for the provision of climate and environmental services_2025-26 APT_8463_EN1988_2025_26

Land-use and ecosystem management are a key component of the environmental footprint of local communities, whether urban or rural. It encompasses impacts within and outside the geographical boundaries of these communities, because demand for ecosystem services may have consequences on distant countries through products imports or indirect market-related effects. Thus, designing and assessing strategies that minimize this footprint at product, citizen or community levels requires a thorough understanding of human, ecosystem and environmental responses involved in the underlying scenarios, from local to global scales. These responses may be analyzed using biophysical models of ecosystem functioning and ultimately the earth/climate system, and economic models describing the market mechanisms by which a local demand may translate into global consequences on the use and management of land worldwide.

The objective of this course is to raise the awareness of students regarding the biophysical and economic processes involved in the response of land-use and climate to economic drivers, and to equipthemwith state-of-the-art know-how on the modelling of these processes, across a range of scales. Case-studies involving these models will serve to illustrate how they may be used to design and assess low-carbon strategies . 

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EN1991-Public policy for climate and environmental regulation_2025-26 APT_8464_EN1991_2025_26 Sustainable development involves three aspects: economic development, social development, and environmental protection. The last item is widely discussed in the CLUES Master, by dealing with the interactions between human activities and environment through Earth sciences. However, in order to solve the current ecological challenges, it is necessary to build up biotechnical solutions economically and socially relevant (and so to be considered by policy makers…).This course aims to provide knowledge on these non-technical subjects for which economical, social and political challenges are particularly developed. In addition, since terrestrial ecosystems (e.g., forests, crops, but also urban ecosystems) are both sinks and sources of greenhouse gases (GHG), they can held mitigation strategies for climate regulation, but have to adapt themselves to climate change. Voir le cours
EN1985-Ecology under climate change_2025-26 APT_8465_EN1985_2025_26 Le module Ecology under Climate Change a pour enjeu d'étudier les effets du changement climatique sur la biodiversité des écosystèmes, le fonctionnement des écosystèmes et les services écosystémiques rendus par ces écosystèmes. Outre une étude et une compréhension de l'écologie des écosystèmes sous changement climatique, un des enjeux est d'appréhender les effets des interactions entre les différents facteurs du changement climatique sur la structure et le fonctionnement des écosystèmes, mais aussi les effets de rétroactions des écosystèmes sur le climat.Différents aspects de cette problématique seront développés :les effets du changement climatique sur la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes,les relations entre biodiversité et fonctionnement des écosystèmes,la résistance et la résilience des écosystèmes vis à vis des perturbations - évènements météorologiques extrêmes,les effets du changement climatique sur les communautés végétales et les communautés microbiennes du sol impliquées dans le cycle du C et le cycle de l'N,les effets des interactions entre facteurs du changement climatique et les rétroactions des écosystèmes sur le climatles méthodes d'études de l'écologie sous changement climatique - observations, expérimentations, modélisationles enjeux actuels de l'écologie sous changement climatique : interface scientifique et politique  Voir le cours
EN1986-Integrated assessment of ecosystem services and sustainability_2025-26 APT_8466_EN1986_2025_26 Le cours vise à sensibiliser les étudiants au management environnemental, aux normes ISO 14 000 et aux principes de leur mise en œuvre dans différents contextes décisionnels pour améliorer la performance environnementale des systèmes de production ou des organisations. Le cours fournira aux étudiants les outils et méthodes actuellement utilisés dans ce processus pour l'évaluation environnementale des produits et services, et leur éco-conception. L'analyse du cycle de vie, dont l'utilisation se répand actuellement dans tous les secteurs économiques à des fins d'éco-conception, d'information des consommateurs ou de conception de politiques, occupera une place centrale dans la pédagogie. Voir le cours
EN8757-Modelling concepts and applications_2025-26 APT_8471_EN8757_2025_26 Modelling concepts and applications Voir le cours
EN2008-Mise à niveau et terrain_2025-26 APT_8475_EN2008_2025_26 Objectifs :Permettre aux étudiants de faire le point sur leurs connaissances de base en Science des Sols, afin qu’ils puissent remédier rapidement à leurs éventuelles lacunes.Former les étudiants à observer et décrire des sols sur le terrain, et à comprendre comment ces sols sont distribués en fonction de la géomorphologie d’une région.A partir de caractères observables in situ, être capable de formuler des interprétations sur la formation,le fonctionnement et l’utilisation durable des sols.Acquisition de bases pour nommer les sols. Voir le cours
EN2002-Ecologie et biogéochimie des sols_2025-26 APT_8476_EN2002_2025_26 Les organismes du sol jouent un rôle clef dans le fonctionnement des sols et les services écosystémqiues associés.Ce module, constitué de conférences et TD, permet :- d'acquérir des connaissances sur le fonctionnement biologique et biogéochimique des sols, les facteurs qui affectent la survie et l’activité des êtres vivants et des enjeux actuel de l'écologie et de la biogéochimie des sols- de comprendre les interactions entre fonctionnement biologique, physicochimique et physique du sol à différents niveaux et échelles,- d'acquérir des compétences et des capacités d’analyse de la perturbation du fonctionnement biologique et biogéochimique du sol sous l’effet d’actions anthropiques (pollutions, technosols...),- d'acquérir des connaissances sur la valorisation des organismes vivants dans la dépollution des sols Voir le cours
EN2004-Géomatique pour les sols_2025-26 APT_8477_EN2004_2025_26 L’objectif de l’UE est d’initier les étudiants aux différents aspects de la géomatique pour comprendre, analyser et gérer la variabilité spatiale des sols. Voir le cours
EN2007-Les sols dans le temps et l'espace_2025-26 APT_8479_EN2007_2025_26 Mettre en relation les facteurs de formation des sols et les caractéristiques de la couverture pédologique à différents niveaux d’organisation :Les grandes lois de variabilité des sols, processus de formation, d'évolution et de dégradation des sols, du profil à la planète et de l'année aux millions d'années.Influence de l’Homme et enseignement en termes de gestion durable des sols. Voir le cours
EN2009-Modélisation des processus dans les sols_2025-26 APT_8480_EN2009_2025_26 L’objectif du module est de fournir aux étudiants les outils de base pour développer et utiliser des modèles en fonction de différentes finalités en science du sol, en comprendre les avantages mais aussi en percevoir les limites. Voir le cours
EN2010-Physicochimie des sols_2025-26 APT_8481_EN2010_2025_26 Objectifs:(i) Acquisition de connaissances sur le fonctionnement bio-physico-chimique des sols en mettant l’accent sur a) la nature, l’origine et évolution et la réactivité des constituants organiques et minéraux, b) les processus physicochimiques (dissolution, sorption, complexation) et biogéochimiques (réactions redox) qui contrôlent la dynamique des éléments majeurs et traces et des molécules organiques dans les sols.(ii) Acquisitions de connaissances méthodologiques (modélisation en géochimie des solutions)Contenu:Thèmes abordés : Cours :- Caractérisation et réactivité des constituants inorganiques (cristallins et amorphes).- Nature, composition et évolution des matières organiques naturelles; propriétés acides et réactivité.- Echange ionique, adsorption spécifique, autres.- Processus redox dans les sols. TD :- Adsorption ionique et non ionique.- Acidification, pouvoir tampon et chaulage.- Intérêt de l'analyse de terre pour réaliser un diagnostic de fertilisationTravail de groupe:- Réactivité des matières organiques, complexation, NICA-Donnan model. Voir le cours
EN2015-Transferts dans les sols et la ZNS_2025-26 APT_8482_EN2015_2025_26 L'objectif du module est de donner aux étudiants les bases de la compréhension des transferts d'eau et de solutés dans les sols. Les étudiants formés seront capables d'interpréter des mesures de teneur en eau et de potentiel de l'eau dans les sols, de calculer la réserve en eau des sols et leurs variations saisonnières, de prévoir les transferts d'eau entre le sol et les plantes, de comprendre les relations entre les transferts de l'eau dans le sol et le déterminisme des pollutions des eaux de surface et des eaux souterraines.  Voir le cours
EN1966-Diagnostic agronomique et paysager à l'échelle de l'exploitation agricole_2025-26 APT_8514_EN1966_2025_26 L'UE, centrée sur l'exploitation agricole, propose de montrer, par la théorie et par l'expérience, les atouts et les contraintes d'une démarche pluridisciplinaire visant à saisir les articulations et les synergies entre deux approches, agronomique et paysagère : celles de l'analyse de la structure et du fonctionnement des exploitations agricoles, et celles de la lecture de paysage. Ainsi seront abordés dans un premier temps les enjeux théoriques et méthodologiques d'un tel rapprochement : les systèmes d'exploitation s'adaptent aux milieux mais aussi les aménagent, ce qui a un rapport étroit avec la démarche du paysagiste. De même, le paysage est pour l'agriculture, en particulier dans les paradigmes de l'agroécologie, une ressource essentielle à saisir dans la question de la conception spatiale de systèmes agroécologiques. Ce sont toutes ces connexions et ces mises en relation entre milieux (biophysiques), paysages (composantes et structures visibles mais aussi perceptions et représentations sociales) et activités agricoles, que les participants à cette UE esquisseront dans un second temps, par un exercice sur le terrain.  Voir le cours
EN8780-Statistiques 2_2025-26 APT_8515_EN8780_2025_26 Contexte :La statistique est un élément fondamental de la démarche scientifique expérimentale. Les étudiants en biologie doivent avoir de bonnes connaissances de base dans ce domaine. L'objectif de l'UE est de former les étudiants aux raisonnements de la statistique, qu'ils comprennent la construction des outils de base de la statistique, sachent les employer de manière appropriée selon le problème posé et interpréter de manière critique les résultats issus de logiciels. Contenu : Modèle linéaire (régression linéaire, ANOVA, ANCOVA) Voir le cours