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| Fullname | Shortname | Summary | |
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| 2A-D4-UC Biol Struct-SCD4 - Biologie structurale et santé_2024-25 | APT_2020_2A_D4_UC_Biol_Struct_2024_25 | L’objectif de cette unité d’enseignement est de montrer l’importance des données structurales (de l’échelle atomique à l’échelle cellulaire) pour comprendre et modifier les fonctions biologiques. Pour cela, elle présente quelques exemples en biologie-santé à travers des cours, conférences et travaux dirigés. Elle fait le lien avec des applications biotechnologiques. | See course |
| MAST 06-Créativité et design thinking_2024-25 | APT_20260_MAST_06_2024_25 | Le but du module créativité de MasterNova est de former les participants aux concepts et outils au service de leur créativité, de celle des équipes, projets et organisations innovantes. | See course |
| SILAT C1-Outils ETL_2024-25 | APT_20262_SILAT_C1_2024_25 | Dans la pratique de son métier, le géomaticien est souvent amené à répéter un grand nombre de fois et presque à l'identique un même enchaînement de géo-traitements réalisés avec un S.I.G. C'est par exemple le cas lorsqu'une même carte issue d'un travail d'analyse spatiale doit être produite chaque année, ou bien lorsqu'un géotraitement complexe doit être appliqué à plusieurs cartes en même temps. Pour gagner en efficacité, il est souvent utile d'automatiser ces tâches répétitives; sous QGIS, cette automatisation passe par la création de plugin et la mise au point de scripts de géo-traitements (Python). D’autres outils comme les logiciels ETL (Extract, Transform & Load) permettent aussi d’automatiser des chaînes de traitement de données. Outre un gain considérable en efficacité, ces outils permettent au géomaticien de créer des chaînes de géo-traitements plus fiables, plus souples, facilement reproductibles et communicables. | See course |
| SILAT C2-Python : API QGIS_2024-25 | APT_20263_SILAT_C2_2024_25 | Dans la pratique de son métier, le géomaticien est souvent amené à répéter un grand nombre de fois et presque à l'identique un même enchaînement de géo-traitements réalisés avec un S.I.G. C'est par exemple le cas lorsqu'une même carte issue d'un travail d'analyse spatiale doit être produite chaque année, ou bien lorsqu'un géotraitement complexe doit être appliqué à plusieurs cartes en même temps. Pour gagner en efficacité, il est souvent utile d'automatiser ces tâches répétitives; sous QGIS, cette automatisation passe par la création de plugin et la mise au point de scripts de géo-traitements (Python). D’autres outils comme les logiciels ETL (Extract, Transform & Load) permettent aussi d’automatiser des chaînes de traitement de données. Outre un gain considérable en efficacité, ces outils permettent au géomaticien de créer des chaînes de géo-traitements plus fiables, plus souples, facilement reproductibles et communicables. | See course |
| FNS-M12.1_Projet_Mission_Pro-Projet de mission professionnelle et communication scientifique_2024-25 | APT_20286_FNS_M12_1_Projet_Mission_Pro_2024_25 | Au plan scientifique, le projet de stage répond à deux exigences : (1) Appréhender de manière critique la production existante sur une situation donnée dans le but d’une capitalisation ; (2) Construire une démarche d’analyse clarifiant ses ancrages théoriques et méthodologiques.L’étudiant est formé et accompagné pour pouvoir rédiger et soutenir un projet de recherche lié à la commande passée par l’organisme l’accueillant en stage. Ce projet doit inclure une revue bibliographique, l’explicitation des hypothèses ou des questions posées, les méthodes à développer, les résultats attendus, le chronogramme et un aperçu de la logistique disponible. Ce projet peut être amélioré grâce à l’évaluation du document par un jury et de sa soutenance. | See course |
| FNS-M12.2_Mission_Pro-Mission professionnelle_2024-25 | APT_20287_FNS_M12_2_Mission_Pro_2024_25 | Le stage de mission professionnelle a pour objectifs la mise en oeuvre des connaissances et compétences acquises durant la phase d’enseignement et l’insertion dans un réseau professionnel. Il permet de réaliser un travail de manière individuelle, en bénéficiant d’un encadrement individualisé. Dans le cadre de la réalisation de la mission professionnelle, les auditeurs sont amenés à travailler dans un contexte international et souvent en zones tropicales parfois isolées géographiquement et économiquement, où les capacités d’adaptation, d’autonomie, et d’initiative seront fortement sollicitées.Le stage de mission professionnelle porte généralement sur des problèmes d'environnement au sens large en zone tropicale, tant dans le cadre d'écosystèmes « naturels » que de systèmes de production incluant l'arbre en tant que composante majeure.La préparation de ce stage demande un investissement de l’auditeur tout au long de la séquence d’enseignements. Elle nécessite la sollicitation des différentes instances et institutions historiquement partenaires d’AgroParisTech dans les domaines de compétences de l’équipe pédagogique : de la recherche (CIRAD, IRD, Inra, CNRS, Universités …), de l'enseignement supérieur (Montpellier Supagro, IAMM), du secteur public (administrations centrales, collectivités territoriales et/ou locales, établissement parapublics), du secteur privé (bureaux d’étude, instituts technique, entreprises privées) et du secteur des organisations (Organisation internationales, ONG, associations locales et/ou nationales) aussi bien en France qu’à l’international. Les membres de l’équipe pédagogique apportent un appui sur l’orientation vers les structures professionnelles et conseillent sur la thématique choisie. Le travail de réalisation de l’étude se fait en réponse et en co-construction avec une commande formulée par l’organisme d’accueil, tout en mettant en oeuvre des capacités d’analyse critique vis-à-vis de cette commande. Le sujet et les conditions matérielles et d'encadrement du stage sont validés par le personnel enseignant de la formation et par le tuteur après évaluation d'un document de projet soutenu devant jury.La partie « mission » du stage se déroule, sauf exception, à l’international et a pour but de confronter les auditeurs à la réalité du terrain et leur apporter l’expérience nécessaire pour la compréhension des dynamiques locales.Le stage aboutit à la rédaction d’une thèse professionnelle et à une soutenance publique devant un jury composé au moins du tuteur de stage, de l’enseignant-référent AgroParisTech et d’un rapporteur extérieur travaillant sur une thématique en rapport avec le stage, l’un de ces membres devant être un enseignant-chercheur. | See course |
| Mon_BioGET_SIG-Cours en ligne SIG (UE supplémentaire)_2024-25 | APT_20305_Mon_BioGET_SIG_2024_25 | Initiation aux SIG pour des écologues | See course |
| Ath-AGROPT22-AGROPT22 Animals in Science: Today's Challenges_2024-25 | APT_2036_Ath_AGROPT22_2024_25 | This unit is in English.
Livestock farming faces many scientific challenges, as do its professionals. |
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| Ath-AGROPT23-AGROPT23 - Nutrition en Conditions Extrêmes_2024-25 | APT_2037_Ath_AGROPT23_2024_25 | Les thèmes suivants seront abordés :Dynamique digestive et mise à disposition des nutriments (monogastriques, polygastriques)Nutrition et efforts (chiens de traîneau, sportifs de haut niveau, treck....)Epargne et déposition musculaire : statégies alimentaires. Adaptation à une production intense (production laitière)Adaptation à la sous alimentation (sous alimentation dans les zones desertiques, jeûnes, ...). Alimentation en autonomie (raids longue durée, vol spatial, ....) | See course |
| UC1-05-Biologie intégrative, introduction à la complexité du vivant_2024-25 | APT_2066_UC1_05_2024_25 | Contenu de l'enseignement :Introduction module et bases de l'intégration en biologie + distribution d'articles (cours),Génomique appliquée à la sélection animale (cours),Intégration en ecophysiologie (cours),Approche de mesure des flux métaboliques chez l'homme (cours & TD),Intégration et modélisation réseau métabolique des microorganismes (TD),Acquisition image confocale (démonstration) et analyse d'image chez les plantes (TD),TD : De l'image au modèle statistique - exemple de reconstruction 3D d'une cellule et de ses compartiments,TD : Intégration transcriptome et protéome chez la plante, 9- Approches intégrées en biotechnologie végétale (cours) | See course |
| UC2-25-L'atmosphère : milieu d'échanges, de transports et de régulations_2024-25 | APT_2070_UC2_25_2024_25 | L'enseignement est fondé sur les connaissances déjà acquises en 1A. Il approfondit les connaissances des étudiants sur la turbulence, sur les échanges végétation-atmosphère et leur régulation ainsi que sur les couplages existants entre biologie et physique de l'environnement. On introduira également les étudiants à la résolution numérique des problèmes d'écoulement et de transfert. Si le mini-projet , fil conducteur de la pédagogie du module reste essentiellement concentré sur des problématiques à l'échelle locale, la circulation atmosphérique générale et les problèmes soulevés par l'effet de serre additionnel seront le cadre de conférences réalisées par des spécialistes de ces questions actuelles. Elles illustreront les mécanismes physiques décrits en cours à une échelle plus globale. | See course |
| UC1-09-Dendrométrie, croissance et production des peuplements forestiers_2024-25 | APT_2073_UC1_09_2024_25 | L’UC vise à fournir les bases nécessaires aux métiers de la gestion forestière en termes de biométrie forestière (caractérisation quantitative de l'arbre, du peuplement, et du massif forestier) et de caractérisation des peuplements forestiers et de leur dynamique (concepts, méthodes, modèles).Caractérisation dendrométrique de l'arbre : diamètre, hauteur, forme et volume. Définitions des grandeurs, appareils et méthodes de mesure, analyse et précision des mesures, estimation indirecte par tarif de cubage. Caractérisation dendrométrique des peuplements : densité, surface terrière, volume, hauteur dominante. Analyse de données d'inventaire forestier et calcul de la précision des estimations.Caractérisation du système étudié avec les niveaux peuplement et arbre. Développement de l'arbre. Phénomènes et processus dynamiques à l'échelle de l'arbre et du peuplement. Concepts et méthodes d’évaluation de la production. Changements de productivité. Approches de modélisation de la croissance forestière. | See course |
| UC1-02-Analyse économique_2024-25 | APT_2074_UC1_02_2024_25 | AVERTISSEMENT: pour l'année 2024/25, ce cours sera ouvert à la fois sous forme classique et en "classe inversée". Pour la plupart des cours ayant lieu le matin les étudiants auront le choix de suivre en présentiel ou de travailler chez eux des vidéos de cours pré-enregistrées. Seuls certains cours seront assurés de manière classique. L'après midi des applications de ces cours autour de TD ou de problèmes concrets seront ensuite enseignées en présentiel, dans une démarche participative.Ce module combine des séances de cours fondamentaux en microéconomie, des travaux dirigés et des conférences thématiques qui portent sur l'utilisation concrète des outils de l'économie. Des intervenants expliquent comment ils utilisent au quotidien des concepts présentés en cours, à la fois dans l'administration, dans les institutions financières privées et dans la recherche universitaire. Le cours est généralement assez formalisé, mais ne requiert que des connaissances minimales en mathématiques - Microéconomie (consommateur, producteur, séance d'exercice, programmation linéaire) - Economie publique (optima, inefficacité d'un marché en présence d'externalités, de biens publics, de concurrence et d'information imparfaite) - Etude de cas en économie de l'environnement et en politique agricole - Economie internationale: étude de cas dans les négociations internationales - Politique de la concurrence - Analyse économique de la déforestation. | See course |
| UC1-04-Bioingénierie des protéines et applications industrielles_2024-25 | APT_2075_UC1_04_2024_25 | Le programme comporte des cours, des conférences, des TP et TD sur les méthodes d'études structurales des protéines et sur diverses applications, illustrés par une visite d'entreprise pharmaceutique.- COURS ET CONFERENCES - Méthodes d'étude expérimentales des structures tridimensionnelles des protéines (radiocristallographie, résonance magnétique nucléaire, cryomicroscopie électronique, spectrométrie de masse), prédiction informatique des structures 3D protéiques. Relations structure-activité - Exemples d'applications industrielles: enzymes (agroalimentaire, détergents, textile), inhibiteurs de sialidases contre la grippe, laccases fongiques et dépollution, vaccinologie sructurale. - Développement d'une start-up biotechnologique, dépôt de brevets. - TRAVAUX PRATIQUES ET TRAVAUX DIRIGES - Initiation à la cristallographie des protéines (lysozyme). - VISITE : - Centre de Recherches Sanofi-Aventis, Département de biologie structurale, Vitry-sur-Seine | See course |
| UC1-07-Ce que nous apprennent les génomes_2024-25 | APT_2076_UC1_07_2024_25 | La génétique des populations humaines - La polyploïdie et l'évolution des éléments transposables - L'évolution du génome des plantes - La phylogénie moléculaire - Les processus de spéciation - Génétique des populations et signatures de sélection - Epigénétique/épigénomique - Réseaux de régulation des gènes - Innovations biotechnologiques et édition de génome - Cellules souches - Génomique, science et société. Panorama des méthodes de séquençage incluant les projets de séquençage de génomes complets et les NGS (Next Generation Sequencing) - Présentation des bases de données existantes - Interrogation des bases de données. Les applications en biomédecine et agronomie. Métagénomique et microbiote. | See course |
| UC5-27-Communication Nutrition-Santé sur les produits alimentaires_2024-25 | APT_2077_UC5_27_2024_25 | La qualité nutritionnelle et de santé des aliments commercialisés fait l'objet d'une forte attention par le consommateur. De nombreux produits (aliments courants ou compléments alimentaires) suggèrent ou revendiquent un intérêt nutritionnel et/ou un bénéfice pour la santé du consommateur et cette communication est au coeur d'enjeux importants. Les enjeux de la communication nutrition-santé se trouvent au croisement de la science nutritionnelle, en essor, des règles du Droit, en mutation, et des velleités d'innovation et de positionnement du secteur marchant. Cette UC aborde donc ce sujet de façon interdisciplinaire, et par des approches par l'objet. | See course |
| UC1-12-Food safety and risk analysis through the food chain_2024-25 | APT_2078_UC1_12_2024_25 | Since the '90s awareness about food safety among consumers has increased, while the standards and progress in conservation and traceability could suggest the disappearance of this type of problem. The word "chemical hazard" sounds still bad, as shown by the recent case "Fipronil eggs contamination" and mass media often contribute to an exaggerated perception of the real hazards. In this context, it seems necessary to provide a better knowledge of the relationship between modes of production and processing of agricultural commodities and food safety for humans. How can we objectively assess the impact of exogenous, endogenous and newly formed contaminants? How regulation (at French, European and global levels) allows it to protect consumers' health while providing a modern industrial production and fair trade rules? The aim of this module is to give the principles of risk analysis steps (assessment, management, communication) throughout the whole food chain in order to provide valuable tools to control and solve critical cases. An engineer familiar with the principles of assessment and control of chemical risks possesses precious tools for managing and controlling critical cases. Within this course, we will mobilize study cases illustrating similarities and differences existing between food industries regarding risk management. | See course |
| UC1-14-Localisation des productions animales : dynamiques et déterminants_2024-25 | APT_2080_UC1_14_2024_25 | Il s'agit de comprendre, au travers d'une présentation globale puis de quelques études de cas ou zoom, les évolutions passées et en cours des productions animales, à différentes échelles, et d'en comprendre les déterminants. | See course |
| UC1-10-Diagnostic des écosystèmes forestiers (DEF3)_2024-25 | APT_2081_UC1_10_2024_25 | Cette UE donne les principes et les bases du diagnostic des écosystèmes forestiers dans toutes les composantes (climat, sol, flore, peuplement). Elle associe des cours magistraux (21 h), des TD en salle (4,5 h) et des sorties à la journée ou la 1/2 journée (39 h). Elle s'étend de septembre à octobre. Le contrôle de connaissances se fait par un compte rendu de tournée, une présentation orale d'un cas d'étude, le rendu d'un herbier et un examen de dendrologieCette UE est indispensable pour suivre les autres UE notamment les enseignements en sylviculture, en écologie végétale, en gestion forestière ou des milieux naturels... | See course |
| UC1-16-Procédés Alimentaires : de la théorie à la pratique_2024-25 | APT_2082_UC1_16_2024_25 | Un grand nombre de procédés de transformation et conservation s’appuient sur des traitements thermiques par la chaleur (concentration par évaporation, séchage, cuisson...) ou par le froid (congélation, réfrigération, cristallisation...) et sur des opérations de séparations (filtration, cristallisation, distillation, échanges d’ions...). Ces procédés sont connus et existent pour la plupart à l'échelle de la cuisine, mais pour une utilisation à une échelle industrielle, ils nécessitent de savoir dimensionner et concevoir des procédés et de contrôler leur fonctionnement, le tout dans des conditions optimales de maîtrise de la qualité et d’impact sur l’environnement.Cet enseignement présentera le principe de quatre opérations unitaires de transformation (évaporation, séchage, filtration) et de conservation (refroidissement/ congélation) . Il s'appuiera sur les notions de bilans et transferts abordées dans l'UE Génie industriel des aliments et bioproduits. Puis pour chaque opération, il abordera les paramètres de dimensionnement, de choix technologiques possibles et de conduite appliqués à des exemples concrets. | See course |
| UC1-06-Biomolécules et synthons : de leur production par voie biotechnologique à leur extraction_2024-25 | APT_2083_UC1_06_2024_25 | La production de molécules fonctionnelles et de synthons par des voies biotechnologiques à partir des bioressources représente un potentiel particulièrement riche d'innovations et constitue une alternative aux procédés chimiques dans un souci économique et de respect de l’environnement. De part sa formation en lien avec le Vivant, le futur ingénieur AgroParisTech aura un rôle majeur à jouer dans ce domaine, tant en R&D qu'en production ou en conseil, auprès d'entreprises oeuvrant dans le domaine des industries pharmaceutiques et des entreprises en biotechnologies blanches, mais aussi auprès de petites start-ups. | See course |
| UC2-01-Adaptation des Plantes à l'Environnement_2024-25 | APT_2084_UC2_01_2024_25 | Un état des lieux : évaluation des pertes agronomiques et économiques causées par la sécheresse, la pollution, les maladies, la salinité, les métaux lourds, ...Exemples de programmes nationaux ou internationaux destinés à identifier des facteurs de résistance à des contraintes environnementales. Importance des ressources génétiques comme réservoirs de gènes de rusticité et d'adaptation. Intérêt des programmes de génomique pour identifier les bases génétiques de la résistance aux stress biotiques et abiotiques. Que pourraient apporter les plantes transgéniques ?Etude de mécanismes physiologiques et biochimiques clés responsables de la résistance aux biotiques et abiotiques.Visite de sites travaillant sur l'étude de la tolérance et l'adaptation des plantes aux stress biotiques et/ou abiotiques. | See course |
| UC2-14-La recherche en agronomie et agroécologie_2024-25 | APT_2086_UC2_14_2024_25 | Les évolutions des agricultures nécessitent, outre des actions politiques et économiques, la production de connaissances nouvelles sur le fonctionnement des agroécosystèmes, et de méthodes pour mettre au point des systèmes agricoles innovants. C'est le propos de la recherche en agronomie (au sens de la discipline Agronomie, donc s'intéressant aux systèmes fondés sur des productions végétales) et agroécologie (qui replace ces systèmes dans des ensembles plus globaux), pour laquelle il existe un regain d'intérêt. | See course |
| UC1-19-Behaviour and Neurobiology_2024-25 | APT_2088_UC1_19_2024_25 | Basic knowledge on some of the following topics (may vary from year to year): * History of the study of behaviour and the different approaches * Neural structures, neuropharmacology, muscular system and neural commands * Behavioural development * Stimuli and communication * Learning and memory * Motivation, emotion, stress * Evolution and behaviour * Social organisationApplications of the study of behaviour : * Behaviour and animal husbandry in the context of the evaluation of animal welfare * Behaviour of insect pests and parasites and using this knowledge for crop protection | See course |
| UC2-02-Agro-ressources : stratégies de valorisation par voie biologique et chimique_2024-25 | APT_2091_UC2_02_2024_25 | La valorisation des resources agricoles en molécules et matériaux passe par la mise en ouvre de procédés de fractionnement du matériel végétal et par la conversion biologique et/ou chimique des constituants permettant d'obtenir les structures ou fonctions recherchées. En vue de pouvoir concevoir et développer de nouvelles voies de valorisation, il est nécessaire de comprendre le principe, les avantages et les limites des outils biologique et chimiques à disposition pour effectuer ces transformations. La chimie « éco compatible » est une démarche visant à réduire ou éliminer l'usage ou la formation de substances dangereuses et/ou toxiques dans la conception, la production et l'utilisation des produits chimiques. L’utilisation de ressources renouvelables constitue l’un des 12 principes de cette chimie « propre ». | See course |
| UC2-04-Bioéthique et Biovigilance_2024-25 | APT_2092_UC2_04_2024_25 | Les principes philosophiques. Les lois de bioéthique. L'éthique dans l'exploration spatiale - La recherche sur les gènes, cellules, organes/organoïdes - l'édition du génome - Les cellules souches - Le don d'organes - La médecine prédictive - La recherche biomédicale et l'éthique de la recherche sur l'homme - L'éthique des expérimentations animales - La brevetabilité du vivant - Les neurosciences - L'agence de biomédecine. | See course |
| UC2-05-Biotechnologies animales_2024-25 | APT_2093_UC2_05_2024_25 | Biotechnologies du génome : génomique structurale et fonctionnelle, transcriptomique, protéomique - présentation, applications et limites de ces approches à haut débit.Biotechnologies de la reproduction : transplantation embryonnaire, fécondation in vitro, sexage, clonage, transgenèse animale.Biotechnologies des aliments et de la nutrition, conséquences pour la qualité des produits animaux et la sécurité du consommateur.Etat des lieux et marché actuel de ces biotechnologies.Bioéthique, brevetabilité du vivant, acceptation sociale. | See course |
| UC2-09-Economie et gestion de la santé_2024-25 | APT_2095_UC2_09_2024_25 | Plusieurs difficultés ont émergé ces dernières décennies dans le domaine de la santé (déficit du secteur de la santé, gestion de la sécurité sanitaire). Ainsi, l'analyse de l'efficacité et l'efficience économique du système de santé ainsi que le management du secteur de santé et ses risques deviennent essentielles.Ce cours s'adresse aux étudiants intéressés par les métiers touchant au secteur de la santé : postes de cadre, contrôleur de gestion, manager ou chargé de mission dans les organisations du secteur de la santé (publiques ou privées, à finalité économique ou non), organisations sanitaires (hôpitaux, cliniques), organisations médico-sociales (établissements d'hébergement des personnes âgées dépendantes, institutions d’accueil des personnes handicapées...), structures associatives œuvrant dans le domaine de la santé…, dans les établissements dont l’activité est liée au bien-être et à la santé (établissements thermaux, instituts de thalassothérapie, spas, entreprises de cosmétiques, entreprises de luxe…), dans les instances de tutelle ou de régulation de ces organisations (ARS, Conseils Généraux...). | See course |
| UC2-15-Mécanismes et évolution de la pathogénie : interactions cellulaires_2024-25 | APT_2097_UC2_15_2024_25 | Introduction à la biologie et à l'écologie des pathogènes : bactéries, virus, champignons et autres parasites. Défenses immunes de l'homme et des plantes vis-à-vis des agents infectieux. Mécanismes de la pathogénie, détournement des fonctions cellulaires et en particulier du système immunitaire. Ecologie des interactions microbe-animaux, microbes-plantes. Techniques d'étude des mécanismes de pathogénie des microbes. Génétique et évolution de la pathogénie, transferts de l'information génétique, évolution des structures. Coût social des maladies infectieuses, moyens de lutte. | See course |
| UC2-17-Méthodes et outils d'analyse spatiale et de diagnostic sylvicole_2024-25 | APT_2098_UC2_17_2024_25 | SIG : cours et TD permettant une utilisation de base des systèmes d'information géographique et des GPS (acquisition et navigation).Application de ces connaissances (et de celles déjà abordées dans d'autres UC du SCD1-forêt en sylviculture et dendrométrie) au cours d'un mini-projet de diagnostic de stations et peuplements forestiers à l'échelle d'un groupe de parcelles. | See course |